More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  73.68 
 
 		 461 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 		 460 aa  919    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  64.35 
 
 		 479 aa  581  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.21 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  52.21 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.96 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.89 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  52.28 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.89 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.19 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.89 
 
 		 457 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  48 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  49.34 
 
 		 455 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.78 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  52.27 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  48.9 
 
 		 455 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  47.28 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.51 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  43.67 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  42.61 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  47.12 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.85 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  43.54 
 
 		 466 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.34 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.87 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  43.08 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  47.24 
 
 		 453 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.7 
 
 		 456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.22 
 
 		 470 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  45.57 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.22 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.22 
 
 		 470 aa  349  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.79 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.78 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.78 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.78 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.39 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.57 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.53 
 
 		 451 aa  343  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.35 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.17 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.35 
 
 		 470 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  46.92 
 
 		 441 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  48.14 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.15 
 
 		 449 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.56 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.2 
 
 		 469 aa  332  6e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.05 
 
 		 464 aa  332  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  39.08 
 
 		 456 aa  332  7.000000000000001e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.44 
 
 		 457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.09 
 
 		 459 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  49.54 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.21 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 		 461 aa  322  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.04 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.52 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  36.38 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.83 
 
 		 461 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.2 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41 
 
 		 462 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.31 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.27 
 
 		 460 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  39.26 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  39.18 
 
 		 462 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.78 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.56 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.24 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.24 
 
 		 495 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.05 
 
 		 460 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 481 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.48 
 
 		 460 aa  310  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.48 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.48 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.76 
 
 		 460 aa  309  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  40.65 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.56 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.75 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.65 
 
 		 482 aa  306  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 		 483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.29 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  40 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.7 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 		 499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.2 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.34 
 
 		 473 aa  303  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.32 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  40.95 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  35.43 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.52 
 
 		 499 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.32 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.22 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>