More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0748 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  80.04 
 
 
456 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  51.81 
 
 
506 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  49.78 
 
 
489 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  52.38 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  49.55 
 
 
441 aa  360  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  45.97 
 
 
461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.56 
 
 
442 aa  348  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  48.37 
 
 
453 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  49.55 
 
 
451 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.7 
 
 
478 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  46.95 
 
 
455 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.7 
 
 
460 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.05 
 
 
458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  44.09 
 
 
455 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  41.98 
 
 
479 aa  313  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.55 
 
 
496 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.95 
 
 
449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.65 
 
 
453 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  41.56 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  42.73 
 
 
470 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.72 
 
 
469 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  42.06 
 
 
460 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  43.97 
 
 
482 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.51 
 
 
461 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.67 
 
 
457 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.67 
 
 
457 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.67 
 
 
457 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40.43 
 
 
466 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  38.51 
 
 
472 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.67 
 
 
453 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.38 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  39.04 
 
 
461 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.59 
 
 
473 aa  285  8e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  40.97 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  43.65 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  40.53 
 
 
462 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.76 
 
 
473 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  40.75 
 
 
462 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
464 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.23 
 
 
470 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  36.07 
 
 
456 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.58 
 
 
461 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.52 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.89 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.61 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  37.66 
 
 
459 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.97 
 
 
451 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.23 
 
 
461 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.86 
 
 
457 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.73 
 
 
470 aa  273  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.95 
 
 
470 aa  273  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.73 
 
 
470 aa  273  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.79 
 
 
470 aa  272  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.16 
 
 
470 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.52 
 
 
462 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  36.46 
 
 
466 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.57 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.07 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.68 
 
 
460 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  37.76 
 
 
461 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  39.48 
 
 
458 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.76 
 
 
464 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.29 
 
 
470 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.71 
 
 
470 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.31 
 
 
459 aa  266  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.89 
 
 
481 aa  266  7e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.54 
 
 
460 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.54 
 
 
460 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.54 
 
 
460 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.01 
 
 
459 aa  264  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  36.15 
 
 
459 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.66 
 
 
482 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  40.09 
 
 
455 aa  263  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.13 
 
 
462 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.74 
 
 
457 aa  262  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  36.5 
 
 
464 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
457 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.23 
 
 
483 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  34.65 
 
 
462 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.07 
 
 
890 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.3 
 
 
464 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  40.55 
 
 
474 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  37.67 
 
 
481 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
464 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.73 
 
 
462 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  38.78 
 
 
461 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.96 
 
 
460 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.66 
 
 
459 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  35.99 
 
 
459 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  36.96 
 
 
461 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  35.99 
 
 
459 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  36.96 
 
 
461 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 
475 aa  254  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.19 
 
 
474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>