More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2018 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 478 aa  905    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  74.3 
 
 		 451 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  60.82 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  57.3 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.06 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  49.68 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.53 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  45.76 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  53 
 
 		 473 aa  355  7.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.67 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  51.88 
 
 		 489 aa  342  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  46.61 
 
 		 455 aa  326  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  45.43 
 
 		 461 aa  326  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.84 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.02 
 
 		 458 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.88 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  42.61 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  44.84 
 
 		 506 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  40 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  43.66 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.66 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.43 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.66 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.43 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  41.01 
 
 		 461 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  40.19 
 
 		 470 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  40.19 
 
 		 470 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.66 
 
 		 470 aa  292  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  43.49 
 
 		 460 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.43 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.43 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.4 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  42.31 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.12 
 
 		 461 aa  289  9e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.19 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  42.58 
 
 		 462 aa  289  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  39.44 
 
 		 472 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.68 
 
 		 461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.67 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.19 
 
 		 470 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.53 
 
 		 496 aa  287  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.29 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  38.52 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  41.81 
 
 		 462 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.65 
 
 		 457 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.85 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  44.84 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.85 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.16 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.16 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.79 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.16 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.99 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  40.3 
 
 		 455 aa  276  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  39.68 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  42.95 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.87 
 
 		 459 aa  273  6e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  39.13 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  39.68 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39.58 
 
 		 457 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.19 
 
 		 469 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.59 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  40.47 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  39.12 
 
 		 462 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.26 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.26 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.18 
 
 		 464 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.43 
 
 		 464 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.99 
 
 		 464 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.26 
 
 		 460 aa  269  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.81 
 
 		 484 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.03 
 
 		 464 aa  269  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  38.54 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  41.56 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.34 
 
 		 459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.84 
 
 		 462 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.76 
 
 		 451 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  35.96 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.21 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.71 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.14 
 
 		 890 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  37.29 
 
 		 461 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.58 
 
 		 758 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.33 
 
 		 471 aa  258  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.25 
 
 		 459 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.99 
 
 		 887 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  38.96 
 
 		 466 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.86 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.82 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.56 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.82 
 
 		 488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.45 
 
 		 493 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.72 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>