More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1780 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
506 aa  1004    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.88 
 
 
456 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.81 
 
 
456 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  51.46 
 
 
489 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  47.84 
 
 
441 aa  330  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  44.12 
 
 
461 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.47 
 
 
458 aa  312  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.42 
 
 
453 aa  306  7e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  46.3 
 
 
455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.51 
 
 
457 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.51 
 
 
457 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.51 
 
 
457 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  46.32 
 
 
453 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
455 aa  296  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  43.47 
 
 
479 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  44.84 
 
 
447 aa  293  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.47 
 
 
453 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.17 
 
 
442 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.43 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.43 
 
 
459 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.86 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  42.69 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.67 
 
 
466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  45.99 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40.65 
 
 
496 aa  283  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.79 
 
 
461 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  47.55 
 
 
473 aa  282  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.1 
 
 
460 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  37.99 
 
 
459 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  41.47 
 
 
481 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  43.57 
 
 
470 aa  280  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 
464 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  38.73 
 
 
459 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  41.9 
 
 
460 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.34 
 
 
478 aa  276  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.86 
 
 
461 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  36.94 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.17 
 
 
449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.97 
 
 
469 aa  274  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 
455 aa  273  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  36.46 
 
 
466 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.54 
 
 
460 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.54 
 
 
460 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 
461 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.54 
 
 
460 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  36.63 
 
 
461 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  40.33 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  37.39 
 
 
500 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.33 
 
 
462 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 
459 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 
459 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.03 
 
 
459 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.61 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.83 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.88 
 
 
497 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  36.58 
 
 
499 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  37.14 
 
 
497 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  36.46 
 
 
499 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  36.85 
 
 
481 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  39.43 
 
 
462 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  36.33 
 
 
499 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  37.36 
 
 
497 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.36 
 
 
497 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.58 
 
 
497 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 
462 aa  264  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  35.31 
 
 
461 aa  264  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  36.86 
 
 
503 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 
461 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.01 
 
 
464 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.99 
 
 
460 aa  262  8.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.23 
 
 
462 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.32 
 
 
474 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.05 
 
 
453 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.47 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  41.27 
 
 
455 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.47 
 
 
497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  35.73 
 
 
499 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.41 
 
 
501 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.44 
 
 
488 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.42 
 
 
457 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  36.5 
 
 
499 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.6 
 
 
470 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 
475 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  36.59 
 
 
461 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  35.93 
 
 
499 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  37.45 
 
 
484 aa  256  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.22 
 
 
488 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  36.58 
 
 
485 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  35.28 
 
 
499 aa  256  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.37 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  34.99 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  43.44 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.69 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.69 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.69 
 
 
470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.69 
 
 
470 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.09 
 
 
493 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  35.67 
 
 
501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.35 
 
 
499 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>