More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1567 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 474 aa  938    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  77.43 
 
 		 460 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.73 
 
 		 464 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.03 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  42.89 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.46 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.96 
 
 		 459 aa  362  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.19 
 
 		 461 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.19 
 
 		 459 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.85 
 
 		 461 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 		 460 aa  346  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.53 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.12 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  42 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  43.85 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  42.95 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.03 
 
 		 459 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  42.73 
 
 		 462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  45 
 
 		 462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  41.86 
 
 		 472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.74 
 
 		 470 aa  336  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.74 
 
 		 470 aa  335  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.51 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  43.42 
 
 		 481 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.51 
 
 		 470 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.28 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.51 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.28 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.51 
 
 		 470 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  40.05 
 
 		 470 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  40.05 
 
 		 470 aa  332  9e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.29 
 
 		 464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.12 
 
 		 469 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.05 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  43.06 
 
 		 464 aa  326  6e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.07 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  41.3 
 
 		 460 aa  320  5e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.37 
 
 		 461 aa  320  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.9 
 
 		 466 aa  317  4e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.83 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  43.91 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40 
 
 		 457 aa  310  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.44 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  40.84 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.53 
 
 		 457 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  36.98 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  38.88 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.91 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  40.05 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  42.6 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  40.05 
 
 		 461 aa  302  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  42.23 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.5 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.96 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  37.96 
 
 		 460 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.19 
 
 		 464 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 		 461 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  34.99 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  37.29 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.88 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.15 
 
 		 462 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  42.89 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  37.28 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  40.6 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  41.4 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.15 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.76 
 
 		 469 aa  294  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.4 
 
 		 461 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 		 462 aa  293  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.06 
 
 		 458 aa  293  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.67 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.27 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0882  FAD linked oxidase domain protein  41.16 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  39.18 
 
 		 479 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.11 
 
 		 459 aa  286  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 		 503 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.05 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.46 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.64 
 
 		 472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  38.91 
 
 		 471 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.52 
 
 		 890 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.38 
 
 		 495 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.38 
 
 		 495 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.18 
 
 		 460 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.36 
 
 		 483 aa  279  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.58 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  41.22 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  34.86 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.31 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  36.12 
 
 		 460 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.65 
 
 		 457 aa  276  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>