More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6354 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  100 
 
 		 453 aa  907    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.89 
 
 		 442 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.09 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  54.18 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  51.42 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  49 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.01 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.61 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.37 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.03 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.03 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.03 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.24 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.1 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  45.2 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  52.22 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  46.51 
 
 		 460 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  47.11 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.55 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.63 
 
 		 496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  48 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  46 
 
 		 462 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 		 455 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.33 
 
 		 456 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  43.05 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  50.79 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.8 
 
 		 464 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.67 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.8 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.16 
 
 		 461 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  44.66 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  45.71 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.61 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  41.89 
 
 		 466 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.35 
 
 		 470 aa  326  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  41.91 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  51.63 
 
 		 473 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.36 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  47.8 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.59 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  46.32 
 
 		 506 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  41.46 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.36 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.13 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  41.72 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  41.9 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  42.13 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.72 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.9 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  45.37 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  42.33 
 
 		 481 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.5 
 
 		 462 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  41.67 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  41.67 
 
 		 470 aa  318  9e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.9 
 
 		 470 aa  318  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.58 
 
 		 459 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  38.38 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.38 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.37 
 
 		 464 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.66 
 
 		 460 aa  313  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.47 
 
 		 464 aa  313  5.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.39 
 
 		 457 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.5 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.93 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  39.21 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.39 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  38.77 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.94 
 
 		 459 aa  296  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.28 
 
 		 469 aa  296  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.09 
 
 		 483 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.47 
 
 		 456 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.79 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  38.8 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.66 
 
 		 459 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.53 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.57 
 
 		 890 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.92 
 
 		 458 aa  289  5.0000000000000004e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.53 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.53 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.31 
 
 		 486 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  41.18 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.91 
 
 		 460 aa  288  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.02 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.24 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  38.02 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  40.86 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.44 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.87 
 
 		 887 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  39.3 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  38.77 
 
 		 459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  42.14 
 
 		 457 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.19 
 
 		 482 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  38.82 
 
 		 509 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  38.77 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.56 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  38.55 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>