More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0865 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
456 aa  907    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  80.04 
 
 
456 aa  734    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  52.88 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4340  FAD linked oxidase domain protein  51.76 
 
 
489 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  52.32 
 
 
447 aa  362  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.85 
 
 
460 aa  352  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  51.77 
 
 
441 aa  352  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  45.67 
 
 
461 aa  348  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  48.69 
 
 
451 aa  336  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.52 
 
 
442 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  47.56 
 
 
455 aa  325  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.42 
 
 
478 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796583  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.73 
 
 
458 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  48.33 
 
 
453 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 
455 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.94 
 
 
469 aa  315  9e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 
464 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  41.3 
 
 
479 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  44.97 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.53 
 
 
449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.96 
 
 
466 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.23 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.14 
 
 
496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.24 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.24 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.24 
 
 
457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  44.03 
 
 
460 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.01 
 
 
453 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  41.28 
 
 
455 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  43.04 
 
 
462 aa  292  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  39.02 
 
 
461 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 
461 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.86 
 
 
466 aa  289  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  43.21 
 
 
482 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.67 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  38.73 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 
472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.53 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.91 
 
 
466 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.47 
 
 
473 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 
464 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.69 
 
 
462 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.9 
 
 
457 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.65 
 
 
457 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 
459 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  35.09 
 
 
456 aa  278  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
460 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.33 
 
 
460 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  37.34 
 
 
459 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.26 
 
 
459 aa  276  6e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.68 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.95 
 
 
470 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  38.68 
 
 
462 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.51 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.95 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.73 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.95 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.95 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.73 
 
 
470 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.95 
 
 
470 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22180  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.26 
 
 
473 aa  272  8.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  36.58 
 
 
461 aa  272  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.69 
 
 
461 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.48 
 
 
482 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 
461 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.95 
 
 
470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.51 
 
 
459 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.79 
 
 
459 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  40.39 
 
 
455 aa  269  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.89 
 
 
460 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.89 
 
 
460 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.34 
 
 
481 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.82 
 
 
451 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 
461 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.26 
 
 
460 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.26 
 
 
460 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 
453 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  33.99 
 
 
462 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.08 
 
 
470 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.07 
 
 
459 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.26 
 
 
460 aa  265  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  39.06 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.68 
 
 
457 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.22 
 
 
462 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 
458 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  34.57 
 
 
461 aa  261  1e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  37.72 
 
 
503 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  40.38 
 
 
462 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  40.38 
 
 
462 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  40.51 
 
 
474 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.12 
 
 
464 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.13 
 
 
474 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  40.14 
 
 
462 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  39.25 
 
 
497 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  36.17 
 
 
481 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.28 
 
 
496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.26 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  37.39 
 
 
509 aa  253  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>