More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1087 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  100 
 
 
471 aa  960    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  67.24 
 
 
471 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  60.81 
 
 
474 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0882  FAD linked oxidase domain protein  53.42 
 
 
473 aa  465  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.41 
 
 
459 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.38 
 
 
459 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  41.48 
 
 
466 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  41.07 
 
 
459 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 
459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.68 
 
 
464 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  40.61 
 
 
459 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.26 
 
 
459 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.21 
 
 
461 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.24 
 
 
462 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.7 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  40.3 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.64 
 
 
470 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.41 
 
 
470 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.64 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.64 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.41 
 
 
470 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.41 
 
 
470 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.41 
 
 
470 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.41 
 
 
470 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.98 
 
 
469 aa  319  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.19 
 
 
470 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.19 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.2 
 
 
456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.74 
 
 
470 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.8 
 
 
457 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 
462 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  38.65 
 
 
466 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 
462 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.39 
 
 
462 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.19 
 
 
460 aa  307  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  36.05 
 
 
460 aa  307  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  41.05 
 
 
462 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.53 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  35.91 
 
 
461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.05 
 
 
460 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.84 
 
 
459 aa  298  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.32 
 
 
466 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.96 
 
 
461 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  41.15 
 
 
459 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.92 
 
 
461 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.69 
 
 
460 aa  293  4e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.48 
 
 
460 aa  292  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.03 
 
 
457 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.48 
 
 
460 aa  292  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  37.95 
 
 
483 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  36.46 
 
 
464 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 
481 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  36.22 
 
 
460 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.74 
 
 
462 aa  285  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.19 
 
 
459 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.55 
 
 
478 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  39.02 
 
 
467 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.64 
 
 
460 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  35.83 
 
 
461 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.57 
 
 
464 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.91 
 
 
474 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  37.39 
 
 
458 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.36 
 
 
462 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.78 
 
 
460 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.85 
 
 
469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.01 
 
 
461 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.83 
 
 
468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  38.11 
 
 
460 aa  269  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  36.52 
 
 
461 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.09 
 
 
466 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.83 
 
 
493 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.73 
 
 
460 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  35.93 
 
 
466 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  39.63 
 
 
441 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  35.41 
 
 
474 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  32.91 
 
 
481 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.85 
 
 
495 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.73 
 
 
461 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.21 
 
 
460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.08 
 
 
481 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.56 
 
 
492 aa  259  5.0000000000000005e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.85 
 
 
495 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  38.08 
 
 
461 aa  259  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.75 
 
 
470 aa  259  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.56 
 
 
464 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.76 
 
 
457 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  32.9 
 
 
489 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.21 
 
 
473 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.5 
 
 
471 aa  257  3e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  36.51 
 
 
461 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  37.81 
 
 
461 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  33.33 
 
 
492 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.59 
 
 
758 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  37.59 
 
 
455 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.11 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.75 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.74 
 
 
486 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>