More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0182 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  100 
 
 		 467 aa  942    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.98 
 
 		 469 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  66.88 
 
 		 461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  62.22 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  56.41 
 
 		 483 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.21 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04382  D-lactate dehydrogenase  56.74 
 
 		 461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  53.42 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.66 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  53.49 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  50.9 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  52.04 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  52.04 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  44.81 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.54 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  44.1 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  44.81 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  44.08 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  44.59 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  45.52 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.81 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.98 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.98 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.09 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  41.09 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.24 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.39 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.17 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.17 
 
 		 460 aa  361  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  40.55 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.47 
 
 		 470 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.91 
 
 		 459 aa  353  5e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.23 
 
 		 470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 		 470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40 
 
 		 470 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  39.04 
 
 		 461 aa  350  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.77 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.53 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.53 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.86 
 
 		 460 aa  349  6e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.53 
 
 		 470 aa  349  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.3 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.3 
 
 		 470 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.54 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  40.32 
 
 		 460 aa  342  7e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.16 
 
 		 459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.76 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.48 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  41.19 
 
 		 462 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  42.63 
 
 		 481 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  41.4 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.65 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.25 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.55 
 
 		 475 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.01 
 
 		 758 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  40.87 
 
 		 474 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.61 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  36.03 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.11 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  36.82 
 
 		 461 aa  316  6e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.21 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.75 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.61 
 
 		 481 aa  313  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  38.11 
 
 		 484 aa  310  4e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.3 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  38 
 
 		 503 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.17 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  38.82 
 
 		 498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.46 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  35.45 
 
 		 461 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.45 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1087  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  39.1 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  38.38 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  37.39 
 
 		 483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  37.61 
 
 		 499 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  36.64 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.86 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.7 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  34.64 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  42.15 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.38 
 
 		 461 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  38.07 
 
 		 499 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.31 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  38.44 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  37.89 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.84 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  35.16 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  34.9 
 
 		 483 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.61 
 
 		 890 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.38 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  37.61 
 
 		 499 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>