More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0132 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  956    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.86 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  42.64 
 
 
466 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  42.43 
 
 
466 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.08 
 
 
461 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  39.53 
 
 
472 aa  324  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.43 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  37.77 
 
 
459 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  38.93 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.07 
 
 
466 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  37.92 
 
 
459 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.73 
 
 
470 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.73 
 
 
470 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  38.15 
 
 
459 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.28 
 
 
470 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.06 
 
 
470 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.51 
 
 
470 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.96 
 
 
459 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.51 
 
 
470 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.44 
 
 
464 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.5 
 
 
459 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.83 
 
 
470 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.42 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 
461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 
483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.03 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 
461 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.92 
 
 
474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  37.61 
 
 
462 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10360  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.5 
 
 
472 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 
485 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.3 
 
 
462 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
461 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  37.83 
 
 
462 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 
470 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 
462 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.28 
 
 
459 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 
481 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  37.61 
 
 
462 aa  280  6e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  36.63 
 
 
457 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  34.83 
 
 
462 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 
481 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 
460 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.85 
 
 
457 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  35.89 
 
 
457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.44 
 
 
460 aa  274  3e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.36 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  34.47 
 
 
474 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.76 
 
 
460 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.19 
 
 
493 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  35.81 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  36.63 
 
 
466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.71 
 
 
464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.17 
 
 
495 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  35.43 
 
 
503 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.17 
 
 
495 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.35 
 
 
470 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.6 
 
 
484 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.67 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.64 
 
 
474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  37.93 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.6 
 
 
482 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.7 
 
 
469 aa  266  5e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.41 
 
 
460 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12303  dehydrogenase  36.49 
 
 
459 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  33.71 
 
 
461 aa  265  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.25 
 
 
497 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.48 
 
 
485 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.18 
 
 
460 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.15 
 
 
470 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.33 
 
 
486 aa  260  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.42 
 
 
494 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.96 
 
 
460 aa  259  9e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.96 
 
 
460 aa  259  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  33.97 
 
 
479 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  34.34 
 
 
461 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.24 
 
 
459 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.02 
 
 
481 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
459 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  32.97 
 
 
499 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  33.26 
 
 
499 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.52 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.85 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.4 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  33.26 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  34.53 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  34.88 
 
 
483 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.06 
 
 
457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  34.45 
 
 
498 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  33.19 
 
 
499 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  31.45 
 
 
464 aa  253  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  34.11 
 
 
480 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.48 
 
 
488 aa  253  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  32.48 
 
 
499 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.84 
 
 
493 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.48 
 
 
488 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>