More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0182 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 464 aa  925    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1567  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  64.73 
 
 		 474 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2544  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  62.28 
 
 		 460 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17661  normal  0.0863212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3899  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.78 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.173674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.92 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.36 
 
 		 462 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.24 
 
 		 464 aa  359  7e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.52 
 
 		 459 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.09 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.13 
 
 		 459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.66 
 
 		 461 aa  349  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.88 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  39.52 
 
 		 472 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  40.65 
 
 		 481 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.51 
 
 		 461 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  40.44 
 
 		 464 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  40.96 
 
 		 462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.46 
 
 		 469 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.39 
 
 		 460 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.28 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  40.74 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  41.1 
 
 		 464 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.35 
 
 		 468 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37 
 
 		 459 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  40.77 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.04 
 
 		 460 aa  310  5e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.04 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.04 
 
 		 460 aa  310  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.55 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0132  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.44 
 
 		 472 aa  309  6.999999999999999e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.75 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.04 
 
 		 456 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1466  FAD linked oxidase domain protein  40.74 
 
 		 458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.991085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  39.36 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  39.36 
 
 		 461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.53 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 		 493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.31 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.34 
 
 		 470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.96 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.09 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.31 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.09 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.31 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.34 
 
 		 470 aa  302  9e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  34.87 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  34.87 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.07 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.27 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.44 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  41.14 
 
 		 461 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  37.71 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.06 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.95 
 
 		 876 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.44 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.5 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  34.15 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.22 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  38.21 
 
 		 466 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  35.46 
 
 		 461 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  38.38 
 
 		 457 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.02 
 
 		 460 aa  292  8e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  37.64 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  35.15 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.51 
 
 		 457 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 		 482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.16 
 
 		 469 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.77 
 
 		 890 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.51 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  32.9 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.45 
 
 		 462 aa  286  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  40.31 
 
 		 467 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  35.88 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.92 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  36.3 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.42 
 
 		 457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 		 483 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.57 
 
 		 461 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 		 475 aa  283  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.39 
 
 		 467 aa  283  7.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  39.87 
 
 		 460 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  41.23 
 
 		 455 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  39.35 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.86 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  35.67 
 
 		 497 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.67 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.66 
 
 		 887 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  38.91 
 
 		 474 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  39.12 
 
 		 459 aa  276  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  39.81 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.7 
 
 		 459 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.36 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 		 481 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 		 480 aa  273  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>