More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0624 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0624  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 
482 aa  960    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  68.55 
 
 
457 aa  595  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.1 
 
 
475 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  45.3 
 
 
472 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  42.01 
 
 
466 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.04 
 
 
469 aa  346  5e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  41.43 
 
 
459 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.74 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  38.37 
 
 
456 aa  332  1e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.8 
 
 
758 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.05 
 
 
459 aa  329  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  40.56 
 
 
459 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.2 
 
 
464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  38.86 
 
 
461 aa  326  7e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 
483 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  40.56 
 
 
459 aa  325  9e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.76 
 
 
470 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  42.39 
 
 
461 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.76 
 
 
470 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  42.29 
 
 
466 aa  325  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.76 
 
 
470 aa  322  7e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.97 
 
 
470 aa  322  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.76 
 
 
470 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.97 
 
 
470 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.97 
 
 
470 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.45 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.76 
 
 
470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.92 
 
 
470 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.21 
 
 
460 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  40.69 
 
 
461 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.54 
 
 
470 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
459 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  41.13 
 
 
462 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.06 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.23 
 
 
459 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  41.54 
 
 
499 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  42.53 
 
 
498 aa  310  5e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.56 
 
 
890 aa  310  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.89 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  42.74 
 
 
483 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  37.63 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.15 
 
 
493 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.78 
 
 
493 aa  306  6e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  41.14 
 
 
485 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.47 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.47 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.47 
 
 
460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.53 
 
 
459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.33 
 
 
460 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.53 
 
 
496 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.22 
 
 
887 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.58 
 
 
459 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.92 
 
 
460 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.61 
 
 
503 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.9 
 
 
494 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 
461 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  38.56 
 
 
492 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1429  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 
487 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  38.54 
 
 
480 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  40.53 
 
 
499 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.34 
 
 
492 aa  296  7e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.77 
 
 
488 aa  295  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  41 
 
 
499 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  40.52 
 
 
499 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
461 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  41.55 
 
 
499 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  40.18 
 
 
499 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.48 
 
 
499 aa  294  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  40.75 
 
 
464 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  38.79 
 
 
499 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  40 
 
 
499 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.28 
 
 
486 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.75 
 
 
493 aa  292  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.29 
 
 
499 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  38.82 
 
 
499 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.25 
 
 
488 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  39.77 
 
 
499 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  39.74 
 
 
499 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  40.37 
 
 
499 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 
482 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  40.17 
 
 
499 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.96 
 
 
484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 
495 aa  290  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.29 
 
 
488 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  40.31 
 
 
483 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  40.09 
 
 
490 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.25 
 
 
488 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.07 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  43.35 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  40.7 
 
 
483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  41.37 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  41.37 
 
 
499 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  39.56 
 
 
499 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  37.64 
 
 
492 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.73 
 
 
460 aa  286  5e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  41.16 
 
 
462 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.96 
 
 
485 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.1 
 
 
497 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.36 
 
 
488 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>