More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0269 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 
467 aa  946    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 
472 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.12 
 
 
470 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.12 
 
 
470 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.12 
 
 
470 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  38.9 
 
 
470 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  38.9 
 
 
470 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.12 
 
 
470 aa  329  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.12 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  38.68 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.68 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.46 
 
 
470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  40.31 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.25 
 
 
470 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.52 
 
 
459 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  38.68 
 
 
459 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  37.94 
 
 
466 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.42 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.55 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  38.65 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.2 
 
 
461 aa  307  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.04 
 
 
460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  37.89 
 
 
461 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 
464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  38.12 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  39.76 
 
 
466 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 
459 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.11 
 
 
464 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 
459 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.96 
 
 
457 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.89 
 
 
459 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  37.01 
 
 
462 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.36 
 
 
462 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2089  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.24 
 
 
444 aa  293  6e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.491336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.76 
 
 
457 aa  290  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  33.99 
 
 
460 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.28 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  39.5 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.28 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.64 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.28 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  35.22 
 
 
457 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.92 
 
 
456 aa  285  9e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  35.68 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.36 
 
 
469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.39 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.17 
 
 
459 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.17 
 
 
460 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  33.83 
 
 
461 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.69 
 
 
461 aa  280  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1218  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.69 
 
 
459 aa  279  9e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.126546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.01 
 
 
461 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  36.9 
 
 
457 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  36.51 
 
 
462 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.2 
 
 
460 aa  278  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 
462 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  38.29 
 
 
456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.48 
 
 
471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  37.9 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0182  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.39 
 
 
464 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.01 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.84 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  34.65 
 
 
481 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  35.03 
 
 
462 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
455 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 
458 aa  270  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.72 
 
 
484 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  35.24 
 
 
460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0755  oxidoreductase, FAD-binding  35.1 
 
 
461 aa  269  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.576129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 
475 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  35.6 
 
 
454 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  34.1 
 
 
464 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2788  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.96 
 
 
758 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.722584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.42 
 
 
469 aa  266  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.84 
 
 
493 aa  267  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 
497 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.75 
 
 
471 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
464 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.1 
 
 
447 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.5 
 
 
468 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.64 
 
 
459 aa  265  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  34.92 
 
 
467 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.33 
 
 
473 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.03 
 
 
463 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  36.03 
 
 
463 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 
474 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 
485 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.76 
 
 
478 aa  262  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  36.11 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.11 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  36.11 
 
 
463 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0049  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.76 
 
 
656 aa  262  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.07 
 
 
481 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.91 
 
 
466 aa  261  2e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.75 
 
 
466 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
470 aa  261  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>