More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2316 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  48.15 
 
 
1018 aa  987    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  48.06 
 
 
1018 aa  983    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  47.36 
 
 
1019 aa  942    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  71.85 
 
 
1006 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  70.69 
 
 
1015 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4607  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.29 
 
 
1017 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173184  normal  0.281232 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6081  FAD linked oxidase domain-containing protein  73.47 
 
 
1023 aa  789    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.99 
 
 
1018 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  47.87 
 
 
1018 aa  979    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  71.06 
 
 
1015 aa  770    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.95 
 
 
1018 aa  914    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 
1012 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 
1006 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4140  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.48 
 
 
1017 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  44.59 
 
 
1011 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  72.54 
 
 
1009 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  72.93 
 
 
1017 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5809  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.9 
 
 
1017 aa  778    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  47.96 
 
 
1018 aa  979    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.48 
 
 
1006 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  48.89 
 
 
1018 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  48.06 
 
 
1018 aa  986    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  63.47 
 
 
1024 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  64.16 
 
 
1010 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.67 
 
 
1006 aa  788    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8623  FAD linked oxidase domain protein  49.56 
 
 
1067 aa  952    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2453  FAD linked oxidase domain protein  46.12 
 
 
1017 aa  910    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.999389  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  48.89 
 
 
1018 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2316  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 
1091 aa  2233    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0331253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  40.35 
 
 
1002 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  72.17 
 
 
1018 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  48.15 
 
 
1018 aa  987    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  45.16 
 
 
1013 aa  879    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2755  FAD linked oxidase domain protein  46.9 
 
 
1017 aa  944    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.190253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  43.05 
 
 
1031 aa  882    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.42 
 
 
1023 aa  890    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.17 
 
 
1005 aa  786    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.34 
 
 
1017 aa  782    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8323  FAD linked oxidase domain protein  62.04 
 
 
1022 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.109641  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.17 
 
 
1018 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.06 
 
 
1018 aa  986    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.72 
 
 
1024 aa  694    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  48.98 
 
 
1018 aa  975    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  48.89 
 
 
1018 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2062  FAD linked oxidase  44.33 
 
 
1010 aa  882    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  43.66 
 
 
1011 aa  892    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  48.89 
 
 
1018 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1450  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.65 
 
 
1014 aa  915    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.05 
 
 
1027 aa  998    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  48.15 
 
 
1018 aa  987    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5622  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.03 
 
 
1020 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45368  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  48.06 
 
 
1018 aa  983    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2596  hypothetical protein  54.5 
 
 
1018 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  55.41 
 
 
1021 aa  587  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.5 
 
 
1018 aa  586  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  54.5 
 
 
1018 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.58 
 
 
1018 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  52.62 
 
 
1021 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2242  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.13 
 
 
1013 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  53.58 
 
 
1013 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2600  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.94 
 
 
1013 aa  556  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.575227  normal  0.0164973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  52.73 
 
 
1016 aa  554  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  53.94 
 
 
1013 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1737  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.4 
 
 
1013 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.187765  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2487  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.94 
 
 
1013 aa  556  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1593  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.03 
 
 
1013 aa  552  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125155  normal  0.43288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1668  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.21 
 
 
1013 aa  552  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.157229  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2071  oxidoreductase, FAD-binding, putative  54.04 
 
 
1007 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.999206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2480  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.39 
 
 
1013 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2998  FAD binding protein  50.44 
 
 
1069 aa  542  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2548  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.25 
 
 
1016 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  51.41 
 
 
1015 aa  535  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.73 
 
 
1026 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.65 
 
 
1023 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1872  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.1 
 
 
1019 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000561674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1604  hypothetical protein  43.45 
 
 
966 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  45.89 
 
 
978 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  30.39 
 
 
1007 aa  347  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.01 
 
 
1007 aa  344  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.89 
 
 
1038 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.59 
 
 
1009 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.2 
 
 
1005 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.26 
 
 
990 aa  321  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.3 
 
 
990 aa  319  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.53 
 
 
1046 aa  318  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  26.73 
 
 
1032 aa  313  9e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.53 
 
 
1025 aa  313  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.04 
 
 
1032 aa  311  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  35.23 
 
 
1014 aa  309  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.84 
 
 
1025 aa  307  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 
983 aa  303  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  33.59 
 
 
996 aa  298  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  27.32 
 
 
975 aa  295  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 
1010 aa  290  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.91 
 
 
978 aa  290  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.92 
 
 
991 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 
973 aa  281  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.79 
 
 
976 aa  278  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.9 
 
 
976 aa  274  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.69 
 
 
968 aa  273  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>