134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4797 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  907    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  51.95 
 
 
432 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  49.88 
 
 
437 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.19 
 
 
440 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  48.26 
 
 
438 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  49.53 
 
 
438 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  49.65 
 
 
438 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  48.03 
 
 
444 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  48.26 
 
 
438 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  48.49 
 
 
432 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.64 
 
 
433 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.47 
 
 
433 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.04 
 
 
435 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 
437 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  43.72 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.78 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.27 
 
 
432 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  42.86 
 
 
433 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  39.91 
 
 
452 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 
433 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  38.83 
 
 
443 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  38.6 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  40.26 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.16 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  39.95 
 
 
440 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  41.19 
 
 
444 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  41.26 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  42.15 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  36.48 
 
 
468 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  37.86 
 
 
452 aa  259  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.77 
 
 
454 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  40.62 
 
 
442 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  39.43 
 
 
472 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  37.44 
 
 
464 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  40.29 
 
 
432 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 
457 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 
457 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.74 
 
 
472 aa  229  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  35.89 
 
 
456 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 
456 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 
456 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  37.28 
 
 
455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 
463 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.39 
 
 
453 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  36.74 
 
 
461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  36.7 
 
 
474 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 
481 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  35.78 
 
 
476 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  34.72 
 
 
431 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  34.37 
 
 
431 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  31.01 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.33 
 
 
445 aa  146  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.76 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.7 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.26 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.26 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.7 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.61 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.26 
 
 
471 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.26 
 
 
478 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.26 
 
 
478 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.26 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  25.73 
 
 
481 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  32.86 
 
 
761 aa  63.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  28.3 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.93 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  27.09 
 
 
473 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.44 
 
 
478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4717  FAD linked oxidase-like  23.19 
 
 
447 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  25.38 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  25.99 
 
 
456 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.95 
 
 
474 aa  55.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.92 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  26.42 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 
433 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.43 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  24.16 
 
 
452 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.39 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.32 
 
 
459 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 
983 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
974 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  27.33 
 
 
437 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  25.35 
 
 
447 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  27.5 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.59 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  29.52 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  22.54 
 
 
578 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.57 
 
 
461 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  29.63 
 
 
428 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  25.3 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.41 
 
 
457 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6649  FAD linked oxidase domain protein  29.01 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477858  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  29.41 
 
 
457 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  29.13 
 
 
1043 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.67 
 
 
483 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  28.07 
 
 
495 aa  47.4  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24 
 
 
452 aa  47  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  24.71 
 
 
499 aa  47  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  35.05 
 
 
452 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>