More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2461 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  100 
 
 		 452 aa  887    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  66.22 
 
 		 455 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.52 
 
 		 454 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  50.56 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.81 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  48.44 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  44.84 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  45.21 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.02 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.77 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  48.55 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  44.03 
 
 		 461 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  39.78 
 
 		 476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  41.19 
 
 		 474 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  46.65 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  41.39 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  41.39 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  41.61 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  41.24 
 
 		 464 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  36.85 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.77 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.8 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  41.81 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  34.19 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.02 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 		 442 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  34.68 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.5 
 
 		 435 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  41.83 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  38.48 
 
 		 432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  39.78 
 
 		 433 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  39.63 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  41.15 
 
 		 432 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.01 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  40.15 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.86 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.16 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.34 
 
 		 437 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  37.13 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 		 425 aa  239  6.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.79 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  38.16 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  35.07 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  39.44 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  39.95 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  31.28 
 
 		 431 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 		 441 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  30.4 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.39 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.7 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  33.51 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  25.99 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  34.27 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  34.83 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  33.72 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.26 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  34.66 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  31.28 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.06 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  35.33 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.79 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1024 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.79 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  22.93 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  36.96 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.86 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  28.16 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.79 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.65 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.79 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  22.86 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  23.79 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.65 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  27.78 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  35.37 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.35 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  33.53 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  32.72 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.73 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  30.38 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  24.16 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  22.73 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  22.02 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  22.02 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.14 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  33.53 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  29.38 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  25.95 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1219  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.9 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.253497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  32.73 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  28.82 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  24.95 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  28.02 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  30.46 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>