99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3634 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
430 aa  865    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.76 
 
 
449 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  50.61 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  53.38 
 
 
423 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.03 
 
 
429 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  48.17 
 
 
418 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  51.46 
 
 
421 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.89 
 
 
462 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  44.17 
 
 
437 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  47.61 
 
 
421 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  43.66 
 
 
448 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  49.76 
 
 
424 aa  362  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  47.01 
 
 
413 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.3 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  48.79 
 
 
418 aa  343  5e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  45.54 
 
 
446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  29.44 
 
 
473 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.32 
 
 
427 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  30 
 
 
435 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  30.34 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.36 
 
 
434 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  30.34 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  29.98 
 
 
437 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  30.09 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  27.42 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  29.47 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  27.12 
 
 
429 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  28.21 
 
 
441 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  28.97 
 
 
438 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  25.26 
 
 
412 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  26.73 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
442 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  27.74 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  28.41 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  30.16 
 
 
436 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  28.72 
 
 
470 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  25.28 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.34 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.12 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  25.65 
 
 
469 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  23.33 
 
 
437 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.86 
 
 
409 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  23.88 
 
 
411 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  23.33 
 
 
437 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  31.28 
 
 
475 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  26.39 
 
 
464 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  23.33 
 
 
437 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  28.1 
 
 
417 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  23.62 
 
 
437 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  23.39 
 
 
437 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  23.39 
 
 
437 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  23.17 
 
 
437 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  23.72 
 
 
437 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  23.29 
 
 
434 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  23.39 
 
 
437 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  22.83 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  26.22 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  41.67 
 
 
452 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  25.99 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
439 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  23.33 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  23.87 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  24.11 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  38.81 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  28.94 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  40.3 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.61 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  37.06 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  27.1 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  34.66 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.26 
 
 
574 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  18.08 
 
 
556 aa  56.6  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  27.35 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  27.04 
 
 
246 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
490 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.52 
 
 
478 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  24.27 
 
 
572 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.45 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.45 
 
 
468 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.45 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.45 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.62 
 
 
478 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.45 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.45 
 
 
471 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  26.45 
 
 
478 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  21.67 
 
 
425 aa  49.7  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  22.95 
 
 
483 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.52 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.84 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  24.42 
 
 
452 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.59 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  35.23 
 
 
761 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.11 
 
 
432 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
376 aa  43.5  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
457 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>