170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1977 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
424 aa  841    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  54.82 
 
 
418 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.68 
 
 
417 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  53.05 
 
 
427 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  49.28 
 
 
448 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  48.69 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.36 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  52.06 
 
 
413 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  49.76 
 
 
430 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.56 
 
 
429 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  47.73 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  49.28 
 
 
421 aa  342  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  45.43 
 
 
418 aa  342  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.86 
 
 
462 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  46.99 
 
 
421 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 
446 aa  289  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  31.44 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  31.28 
 
 
438 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  30.39 
 
 
460 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.47 
 
 
438 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  30.7 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  32.65 
 
 
435 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  31.07 
 
 
437 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  32.01 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  26.85 
 
 
437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  30.02 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  27.15 
 
 
428 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  28.97 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  27.08 
 
 
429 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  29.23 
 
 
415 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  29.95 
 
 
437 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  30.32 
 
 
425 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  30.11 
 
 
470 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  31.45 
 
 
452 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  28.47 
 
 
427 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  37.77 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  27.44 
 
 
478 aa  112  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  28.25 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  29.11 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  39.66 
 
 
417 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.27 
 
 
447 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  34.92 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  33.51 
 
 
437 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  32.99 
 
 
434 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.88 
 
 
464 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  31.96 
 
 
438 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  31.75 
 
 
437 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  44.07 
 
 
432 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  31.44 
 
 
437 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  31.44 
 
 
437 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
437 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  31.44 
 
 
437 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  31.22 
 
 
437 aa  103  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
437 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  27.58 
 
 
439 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  35.18 
 
 
434 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  25.84 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.17 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  37.87 
 
 
442 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  32.61 
 
 
423 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  36.69 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  28.26 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  33.14 
 
 
469 aa  89.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  38.62 
 
 
475 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  33.7 
 
 
574 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  35 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.57 
 
 
556 aa  80.5  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  34.85 
 
 
486 aa  79  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  36.26 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  30.33 
 
 
455 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  25.41 
 
 
572 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  32.72 
 
 
452 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.98 
 
 
504 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  32.43 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  25.93 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
436 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  26.44 
 
 
483 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  28.99 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 
425 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.39 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.26 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  28.22 
 
 
436 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  30.29 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 
366 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  31.09 
 
 
442 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 
503 aa  53.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.16 
 
 
482 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  27.96 
 
 
432 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  31.18 
 
 
558 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.97 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.97 
 
 
478 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 
454 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.97 
 
 
478 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>