220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  100 
 
 
429 aa  853    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  44.69 
 
 
437 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  48.58 
 
 
427 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  50.12 
 
 
418 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  48.56 
 
 
430 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.07 
 
 
449 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 
448 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.31 
 
 
462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  48.56 
 
 
424 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  45.91 
 
 
418 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  46.59 
 
 
413 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.27 
 
 
417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  47.95 
 
 
423 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  46.06 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  44.79 
 
 
421 aa  297  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  38.26 
 
 
446 aa  279  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  31.89 
 
 
441 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  31.6 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  34.16 
 
 
452 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  30.89 
 
 
473 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  26.24 
 
 
437 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  32.41 
 
 
469 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.76 
 
 
434 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  30.66 
 
 
425 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  29.93 
 
 
428 aa  156  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  32.65 
 
 
435 aa  155  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  31.87 
 
 
437 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  25.88 
 
 
437 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  25.44 
 
 
437 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  25.88 
 
 
437 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  25.88 
 
 
437 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  30.21 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  26.05 
 
 
437 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  25.66 
 
 
437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  30.65 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.13 
 
 
427 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  29.8 
 
 
440 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  29.55 
 
 
423 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 
438 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 
432 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  25.56 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  26.76 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  27.73 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  32.59 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  30.05 
 
 
470 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  26.59 
 
 
412 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  27.36 
 
 
464 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  30.15 
 
 
447 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  28.15 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  29.95 
 
 
439 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  28.38 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  27.55 
 
 
445 aa  124  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 
445 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  26.93 
 
 
424 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.05 
 
 
409 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.7 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  27.34 
 
 
439 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  28.1 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  34.1 
 
 
411 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  24.88 
 
 
415 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  27.19 
 
 
417 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25.06 
 
 
415 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  37.85 
 
 
436 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  28.26 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  38.73 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  27.18 
 
 
556 aa  90.9  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  33 
 
 
486 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  29.94 
 
 
574 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.89 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.39 
 
 
504 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  27.53 
 
 
572 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  37.5 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.81 
 
 
478 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  31.45 
 
 
761 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
452 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.87 
 
 
475 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.19 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  31.45 
 
 
481 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.13 
 
 
484 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  27.18 
 
 
481 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  36.15 
 
 
459 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
376 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.37 
 
 
477 aa  60.1  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  32.88 
 
 
460 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 
462 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.64 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.31 
 
 
492 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  35.81 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  32.26 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 
602 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  29.31 
 
 
492 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.52 
 
 
490 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  27.52 
 
 
471 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  27.52 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  27.52 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>