More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4407 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  89.22 
 
 
437 aa  787    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
437 aa  872    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  47.79 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  53.69 
 
 
452 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  51.52 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  50.82 
 
 
441 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  48.95 
 
 
438 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  49.88 
 
 
433 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  50.23 
 
 
425 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  50.93 
 
 
437 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  46.6 
 
 
428 aa  375  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  46.7 
 
 
439 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  49.06 
 
 
432 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  47.11 
 
 
427 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  46.94 
 
 
473 aa  362  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  48.72 
 
 
447 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  45.36 
 
 
486 aa  355  7.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  39.67 
 
 
437 aa  335  9e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  39.44 
 
 
437 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  39.2 
 
 
437 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  39.67 
 
 
437 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  39.44 
 
 
437 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  39.2 
 
 
437 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  44.29 
 
 
470 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  39.2 
 
 
437 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  45.1 
 
 
438 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  44.29 
 
 
445 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  39.2 
 
 
434 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  39.44 
 
 
437 aa  329  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  39.49 
 
 
437 aa  329  7e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  38.97 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  43.56 
 
 
475 aa  309  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  41.76 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  39.09 
 
 
440 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  38.41 
 
 
460 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  36.36 
 
 
469 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  35.86 
 
 
424 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  33.64 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  35.05 
 
 
417 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 
464 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.12 
 
 
445 aa  236  7e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  34.18 
 
 
464 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  33.95 
 
 
442 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  34.59 
 
 
439 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  32.94 
 
 
412 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.55 
 
 
411 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.18 
 
 
409 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 
415 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  29.71 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 
415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  31.86 
 
 
415 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  36.03 
 
 
466 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  33.94 
 
 
418 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.02 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.72 
 
 
417 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
421 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  31.12 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.89 
 
 
429 aa  146  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.98 
 
 
574 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.27 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  27.04 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  31.59 
 
 
446 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  35.21 
 
 
246 aa  126  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  30.41 
 
 
427 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  28.57 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  32 
 
 
572 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 
423 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.4 
 
 
504 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  28.8 
 
 
430 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  30.8 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 
413 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.24 
 
 
642 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  26.69 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  36.22 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.46 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  21.05 
 
 
478 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  49.28 
 
 
69 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  20.99 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.99 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  25.81 
 
 
645 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.9 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  19.57 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  20.99 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  20.99 
 
 
471 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  21.25 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  20.34 
 
 
478 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  25.3 
 
 
539 aa  69.7  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0725  hypothetical protein  23.84 
 
 
584 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790706  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.46 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  25.76 
 
 
586 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.21 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  25.76 
 
 
586 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0949  hypothetical protein  28.17 
 
 
595 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  25.82 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.65 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  29.48 
 
 
586 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6465  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 
582 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>