142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3584 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 423 aa  882    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  78.01 
 
 		 439 aa  690    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  64.52 
 
 		 412 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  59.85 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  59.85 
 
 		 415 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  59.85 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  35.15 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  38.58 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  34.36 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  33.71 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  31.64 
 
 		 437 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  32.86 
 
 		 428 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  32.63 
 
 		 437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  34.37 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  30.66 
 
 		 434 aa  229  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  30.84 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  34.08 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  32.55 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  29.95 
 
 		 437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.22 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  32.31 
 
 		 442 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  30.54 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  30.54 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  30.54 
 
 		 437 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  30.07 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 437 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  29.6 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.44 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  32.09 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  31.38 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.24 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  31.62 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  29.41 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  32.18 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  34.15 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  32.12 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  31.54 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  33.96 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  31.01 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.16 
 
 		 447 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  29.91 
 
 		 433 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  28.41 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  29.69 
 
 		 445 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  28.94 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  28.67 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  29.77 
 
 		 486 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.6 
 
 		 445 aa  176  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.45 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.55 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  26.85 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  27.5 
 
 		 427 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  29.68 
 
 		 418 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 		 449 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  25.95 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  26.57 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  23.89 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  24.04 
 
 		 413 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.61 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.83 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  23.19 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  25.06 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  27.64 
 
 		 572 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  31.68 
 
 		 574 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  27.5 
 
 		 556 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  32.61 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.48 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  28.81 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  28.25 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  28.81 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  22 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  28.81 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  28.81 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  28.25 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 		 490 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.57 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25.71 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.71 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  36.61 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  27.12 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  25.29 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  24.32 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.07 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  26.56 
 
 		 558 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0929  cholesterol oxidase  25.23 
 
 		 586 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0751  FAD binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 586 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0619  cholesterol oxidase  25.56 
 
 		 645 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  21 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  23.26 
 
 		 444 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0762  FAD binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.30819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1737  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1024 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.522031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.87 
 
 		 481 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>