132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88335 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  100 
 
 
556 aa  1156    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  35.26 
 
 
574 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  28.87 
 
 
478 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  24.84 
 
 
441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  29.89 
 
 
434 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  22.85 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  24.06 
 
 
437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.8 
 
 
425 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  28.89 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  35.09 
 
 
437 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  25.77 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  28.61 
 
 
437 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  25.98 
 
 
432 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  34.35 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  31.98 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  24.8 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  27.53 
 
 
437 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  28.62 
 
 
437 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  33.77 
 
 
437 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  33.77 
 
 
437 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
437 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
437 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  33.77 
 
 
437 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  27.1 
 
 
427 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  25.68 
 
 
433 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  30.93 
 
 
452 aa  120  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  22.34 
 
 
438 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  24.18 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  24.66 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 
437 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  26.16 
 
 
435 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  29.44 
 
 
464 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  25.86 
 
 
439 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  26.64 
 
 
469 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  22.82 
 
 
475 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  25.41 
 
 
470 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  22.85 
 
 
445 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  24.03 
 
 
436 aa  104  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  28.46 
 
 
442 aa  103  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  27.8 
 
 
460 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  28.17 
 
 
464 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.37 
 
 
409 aa  100  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  26.55 
 
 
411 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 
445 aa  97.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  26.52 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  26.24 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  27.5 
 
 
423 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.09 
 
 
415 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  24.9 
 
 
418 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  25.2 
 
 
412 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  25.06 
 
 
440 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  23.91 
 
 
429 aa  90.9  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.18 
 
 
429 aa  90.9  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.25 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  20.17 
 
 
572 aa  89  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  25.44 
 
 
415 aa  87.8  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  25.62 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  26.51 
 
 
418 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  23.31 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  20.6 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  23.57 
 
 
424 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  26.17 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  24.1 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.88 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  26.81 
 
 
439 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  25.48 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  21.97 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  23.19 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 
376 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.31 
 
 
504 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  22.17 
 
 
366 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.58 
 
 
462 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  23.7 
 
 
491 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.23 
 
 
483 aa  57  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  18.08 
 
 
430 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.29 
 
 
469 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  23.83 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 
539 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  23.02 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  22.48 
 
 
378 aa  53.5  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  30.81 
 
 
448 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25 
 
 
642 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.71 
 
 
433 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  23.62 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  22.8 
 
 
461 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  25.85 
 
 
432 aa  52  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 
436 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.73 
 
 
433 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2272  hypothetical protein  23.24 
 
 
642 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2244  hypothetical protein  23.24 
 
 
642 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  24.34 
 
 
473 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.39 
 
 
490 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.2 
 
 
473 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  23.08 
 
 
463 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  37.31 
 
 
69 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 
435 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  22.06 
 
 
438 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>