201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4040 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
409 aa  848    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  47.83 
 
 
411 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  36.92 
 
 
464 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.49 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  36.38 
 
 
442 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  35.83 
 
 
470 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  34.58 
 
 
464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  30.93 
 
 
437 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 
437 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 
437 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
437 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  31.87 
 
 
412 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  31 
 
 
438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  31.47 
 
 
437 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  35.73 
 
 
440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
437 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  31.47 
 
 
437 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  31.47 
 
 
437 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  31.22 
 
 
423 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  31 
 
 
434 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  31 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  31.94 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  33.56 
 
 
441 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
469 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  33.83 
 
 
415 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  32.48 
 
 
428 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  32.79 
 
 
433 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  33.64 
 
 
435 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  33.83 
 
 
415 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  33.58 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  33.25 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  32.71 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.37 
 
 
434 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  30.12 
 
 
429 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  33.09 
 
 
439 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  32.4 
 
 
437 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  32.79 
 
 
452 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  32.64 
 
 
427 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  32.55 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  32.88 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 
437 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  30.61 
 
 
436 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  32.79 
 
 
473 aa  192  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  30.66 
 
 
447 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  30.54 
 
 
445 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  28.97 
 
 
425 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  30.02 
 
 
439 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  32.23 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  27.35 
 
 
475 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.46 
 
 
445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 
421 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.89 
 
 
478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  29.95 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 
423 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  27.03 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.05 
 
 
429 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.57 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  27.94 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  28.1 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 
449 aa  109  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  29.81 
 
 
486 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  27.04 
 
 
424 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.29 
 
 
448 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26 
 
 
574 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  26.25 
 
 
430 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.37 
 
 
556 aa  100  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  26.86 
 
 
483 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  24.94 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  25.68 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  25.23 
 
 
446 aa  94  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.11 
 
 
462 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
437 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.95 
 
 
504 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.84 
 
 
642 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.39 
 
 
462 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.4 
 
 
463 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  28.98 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  23.64 
 
 
246 aa  57.4  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.1 
 
 
490 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.56 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.98 
 
 
405 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.89 
 
 
468 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  28.02 
 
 
424 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.24 
 
 
478 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  28.65 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.24 
 
 
478 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.79 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.24 
 
 
471 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  26.4 
 
 
452 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  25.15 
 
 
491 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.24 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.33 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01035  FAD binding domain protein (JCVI)  27.07 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  22.29 
 
 
478 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.29 
 
 
478 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 
366 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>