94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2565 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
421 aa  844    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.4 
 
 
449 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  47.85 
 
 
448 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  46.34 
 
 
437 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  50.48 
 
 
427 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  48.43 
 
 
418 aa  361  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  47.61 
 
 
430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  50.12 
 
 
423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.78 
 
 
462 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  48.58 
 
 
421 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.39 
 
 
417 aa  343  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  45.85 
 
 
413 aa  335  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  48.56 
 
 
418 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  46.99 
 
 
424 aa  319  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  46.06 
 
 
429 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  42.99 
 
 
446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  31.88 
 
 
441 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.39 
 
 
434 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  32.28 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  29.12 
 
 
412 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  30.41 
 
 
435 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  31.46 
 
 
473 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  30.87 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  32.44 
 
 
452 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  27.48 
 
 
439 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  29.48 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  27.36 
 
 
437 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  29.91 
 
 
433 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  28.11 
 
 
428 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  26.13 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  25.11 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  25.06 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  28.21 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  25.06 
 
 
437 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  26.21 
 
 
429 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  28.25 
 
 
437 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  25.46 
 
 
437 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  26.14 
 
 
437 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  25.91 
 
 
437 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  25.91 
 
 
437 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  26.57 
 
 
423 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  25.91 
 
 
437 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  25.91 
 
 
437 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  29.91 
 
 
432 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  31.25 
 
 
437 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  26.44 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  26.71 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  28.18 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  27.91 
 
 
439 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  28.51 
 
 
464 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  27.74 
 
 
470 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  24.83 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  30.31 
 
 
447 aa  113  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.1 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 
445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.84 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  27.03 
 
 
438 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.84 
 
 
415 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  25.12 
 
 
411 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  27.42 
 
 
417 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  27.1 
 
 
415 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 
469 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  27.79 
 
 
486 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  24.32 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  27.47 
 
 
475 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  33.69 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  31.35 
 
 
574 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  27.33 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  35.68 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  21.97 
 
 
556 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  27.32 
 
 
572 aa  70.5  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  32.06 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  29.44 
 
 
483 aa  62.4  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.26 
 
 
504 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.08 
 
 
761 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  23.55 
 
 
558 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 
447 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.67 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  41.18 
 
 
69 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  27.49 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.56 
 
 
481 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.1 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.04 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  44.44 
 
 
246 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  25.79 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  34.64 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08380  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.74 
 
 
479 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2161  hypothetical protein  31.58 
 
 
470 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  27.34 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.74 
 
 
454 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.61 
 
 
475 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.77 
 
 
474 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>