More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1946 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 433 aa  882    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  69.77 
 
 		 432 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  60.05 
 
 		 441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  53.97 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  52.94 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  52.86 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  49.65 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  50 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  49.88 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  48.26 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  46.99 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  47.22 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  49.65 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  49.05 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  48.48 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  44.39 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  45.27 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  44.37 
 
 		 475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  37.79 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  36.62 
 
 		 437 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  36.85 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  35.92 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  35.68 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  35.68 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  36.15 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  35.92 
 
 		 434 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  40.23 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  39.72 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  35.92 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  41.26 
 
 		 470 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  39.95 
 
 		 436 aa  292  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  37.56 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.77 
 
 		 460 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  36.3 
 
 		 442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.6 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  33.26 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  35.55 
 
 		 469 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  34.92 
 
 		 424 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.54 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  31.62 
 
 		 429 aa  226  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  31.46 
 
 		 478 aa  212  9e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  32.71 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  30.84 
 
 		 412 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  29.91 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  30.9 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.22 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  32.33 
 
 		 411 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  32.87 
 
 		 466 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.05 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 		 449 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  30.16 
 
 		 421 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  29.75 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  28.35 
 
 		 574 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  28.64 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.33 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  29.32 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  27.85 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  30 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.68 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  32.87 
 
 		 246 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  31.74 
 
 		 572 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.31 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  25.94 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  27.25 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  38.62 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  29.04 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.81 
 
 		 642 aa  102  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  20.48 
 
 		 468 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  20.65 
 
 		 478 aa  87  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  20.48 
 
 		 478 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  20 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  20.39 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  20.39 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.29 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.29 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  24.4 
 
 		 761 aa  79.7  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  33.14 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  25.71 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  25.91 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  24.43 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  36 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.57 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  30.09 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.28 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  34.62 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  24.67 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  31.91 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.7 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>