61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4288 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  55.07 
 
 
437 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  49.28 
 
 
437 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  40.85 
 
 
478 aa  65.5  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  47.76 
 
 
437 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  42.03 
 
 
574 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  47.76 
 
 
437 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  47.76 
 
 
437 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  54.72 
 
 
445 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  46.27 
 
 
437 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
437 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  46.27 
 
 
437 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  46.27 
 
 
437 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  43.48 
 
 
433 aa  63.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  46.27 
 
 
437 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  46.27 
 
 
437 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  44.93 
 
 
425 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  46.27 
 
 
434 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  42.03 
 
 
437 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  44.78 
 
 
438 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  37.68 
 
 
441 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  40.3 
 
 
442 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  43.08 
 
 
452 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  42.03 
 
 
434 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  39.13 
 
 
473 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  47.17 
 
 
439 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  43.48 
 
 
411 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  40.58 
 
 
470 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  39.13 
 
 
486 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  37.68 
 
 
432 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  38.81 
 
 
464 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  40.54 
 
 
475 aa  53.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  42.03 
 
 
447 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  37.31 
 
 
469 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  38.81 
 
 
448 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.33 
 
 
429 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  34.78 
 
 
429 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  37.68 
 
 
417 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  36.23 
 
 
464 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  34.62 
 
 
438 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 
409 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  36.23 
 
 
438 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  38.81 
 
 
427 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  34.85 
 
 
436 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  41.43 
 
 
437 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  37.31 
 
 
556 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  37.68 
 
 
428 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  34.78 
 
 
427 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  37.68 
 
 
572 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  37.68 
 
 
460 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 
421 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  35.82 
 
 
412 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  40 
 
 
558 aa  46.2  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  34.33 
 
 
424 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.18 
 
 
462 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 
446 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  45.65 
 
 
435 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 
445 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  43.75 
 
 
418 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  32.2 
 
 
475 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.68 
 
 
449 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>