266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6780 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  100 
 
 
438 aa  889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  67.28 
 
 
427 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  59.5 
 
 
441 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  55.05 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  50.69 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  52.86 
 
 
433 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  45.23 
 
 
447 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  45.31 
 
 
435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  45.21 
 
 
425 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  47.26 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  44.12 
 
 
438 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  44.75 
 
 
437 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  44.49 
 
 
473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  45.1 
 
 
437 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  42.79 
 
 
437 aa  332  9e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  42.18 
 
 
439 aa  330  3e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  41.31 
 
 
428 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  42.17 
 
 
486 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  41.46 
 
 
445 aa  305  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  41.82 
 
 
470 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  41.45 
 
 
475 aa  293  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  35.17 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  35.17 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  34.25 
 
 
437 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
437 aa  279  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
437 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.25 
 
 
437 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.25 
 
 
437 aa  277  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  34.25 
 
 
437 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  34.48 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  34.02 
 
 
438 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  34.25 
 
 
437 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  38.36 
 
 
436 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  37.81 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  36.84 
 
 
464 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  37.53 
 
 
442 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.7 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  34.94 
 
 
469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 
445 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  35.31 
 
 
440 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  31.98 
 
 
423 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.88 
 
 
409 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  31.75 
 
 
412 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  32.87 
 
 
429 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  31.7 
 
 
415 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.77 
 
 
415 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  31.25 
 
 
415 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  31.88 
 
 
417 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  31.91 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  31.85 
 
 
478 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  31.07 
 
 
411 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.71 
 
 
449 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  34.02 
 
 
466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 
418 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  31.76 
 
 
421 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.01 
 
 
429 aa  153  5e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 
417 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.52 
 
 
462 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.91 
 
 
424 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.82 
 
 
437 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  30.63 
 
 
418 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  31.54 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  30.23 
 
 
446 aa  141  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  30.47 
 
 
430 aa  136  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  27.31 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  30.87 
 
 
421 aa  133  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  29.07 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  22.34 
 
 
556 aa  127  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.23 
 
 
574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.65 
 
 
504 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  31.14 
 
 
246 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  24.7 
 
 
572 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  27.07 
 
 
483 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.1 
 
 
642 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  27.06 
 
 
539 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
376 aa  63.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.37 
 
 
478 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.15 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  26.82 
 
 
478 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.15 
 
 
452 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  31.91 
 
 
378 aa  60.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.79 
 
 
458 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  34.95 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.96 
 
 
499 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  23.89 
 
 
558 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.95 
 
 
462 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  30.05 
 
 
480 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  25.22 
 
 
452 aa  56.6  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  33.52 
 
 
465 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  28.49 
 
 
457 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  21.87 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.05 
 
 
447 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  24.02 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  32.07 
 
 
463 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.5 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  25.4 
 
 
481 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>