More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1118 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 452 aa  918    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.07 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  52.51 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.91 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1218  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.76 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.126546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.33 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  34.51 
 
 		 466 aa  249  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  34.75 
 
 		 466 aa  246  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  32.51 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  32.51 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.73 
 
 		 470 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 		 470 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.51 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.51 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.18 
 
 		 470 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.28 
 
 		 470 aa  239  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  32.53 
 
 		 459 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 		 459 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  37.18 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  32.69 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.18 
 
 		 460 aa  229  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  32.94 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.72 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.25 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.08 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.08 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.56 
 
 		 476 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.08 
 
 		 460 aa  226  7e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  31.91 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.88 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  32.15 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.65 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.82 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 		 459 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 462 aa  222  8e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.96 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  31.72 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  33.57 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.45 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  31.99 
 
 		 456 aa  221  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.24 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.87 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  34.19 
 
 		 457 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 458 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  31.84 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.59 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.49 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  31.48 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.85 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  32.64 
 
 		 463 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.24 
 
 		 459 aa  217  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  30.86 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  33.02 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  29.66 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  32.49 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  32.49 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.49 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.56 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.02 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  34.38 
 
 		 474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  33.06 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.88 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  31.93 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  32.48 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.19 
 
 		 477 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  33.33 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.47 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 		 469 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.2 
 
 		 462 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.33 
 
 		 474 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.57 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  31.37 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  33.06 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 479 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  31.94 
 
 		 472 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.87 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12710  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.72 
 
 		 470 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.55 
 
 		 466 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  32.32 
 
 		 466 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  30.99 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.91 
 
 		 469 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  32.39 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.37 
 
 		 470 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>