More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1218 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1218  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 459 aa  926    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.126546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.47 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2089  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.491336 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1281  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.34 
 
 		 444 aa  372  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.666679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.1 
 
 		 442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.409643  hitchhiker  0.000186783 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.69 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  38.64 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.52 
 
 		 447 aa  285  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.06 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  35.74 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.41 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  32.91 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  32.91 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  33.62 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  33.05 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.62 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.67 
 
 		 470 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  32.91 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.12 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.91 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.91 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.12 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.83 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.69 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.26 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  32.04 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  32.41 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  35.27 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  33.05 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.84 
 
 		 478 aa  226  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  34.62 
 
 		 462 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  32.9 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  31.17 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.48 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 		 462 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  31.39 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.76 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.93 
 
 		 459 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.84 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.25 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.57 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.82 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  30.69 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.95 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.95 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  30.92 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  31.12 
 
 		 459 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.04 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  32.14 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  31.68 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  31.09 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  32.27 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 461 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  32.61 
 
 		 461 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  31.47 
 
 		 495 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.72 
 
 		 456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 		 474 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 		 469 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.4 
 
 		 463 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 		 469 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  31.37 
 
 		 457 aa  212  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 		 461 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 458 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.77 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.88 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  32.69 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  31.85 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  30.62 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 		 461 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0587  FAD linked oxidase domain protein  34.43 
 
 		 461 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.63 
 
 		 469 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  31.03 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  32.43 
 
 		 461 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 		 464 aa  210  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  32.48 
 
 		 499 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  30.95 
 
 		 463 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  31.15 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  31.26 
 
 		 463 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  31.04 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  31.1 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.85 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  30.84 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.48 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.62 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  31.04 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.75 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  30.79 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.12 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>