More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1837 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1281  FAD linked oxidase domain-containing protein  85.29 
 
 		 444 aa  733    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.666679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2089  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  76.52 
 
 		 444 aa  683    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.491336 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 442 aa  884    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.409643  hitchhiker  0.000186783 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1218  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.1 
 
 		 459 aa  385  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.126546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.64 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.38 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  36.94 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  36.84 
 
 		 466 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  37.29 
 
 		 452 aa  251  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.14 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  37.05 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  34.79 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  34.91 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  34.91 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.7 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.91 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.7 
 
 		 470 aa  243  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.7 
 
 		 470 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 		 461 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.46 
 
 		 459 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.5 
 
 		 478 aa  242  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.84 
 
 		 460 aa  242  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.43 
 
 		 473 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.7 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.7 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  34.52 
 
 		 459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.48 
 
 		 470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  33.48 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.41 
 
 		 470 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.27 
 
 		 470 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 474 aa  239  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.48 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  36.02 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  34.25 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 474 aa  237  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  34.52 
 
 		 473 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  34.43 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 		 464 aa  236  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.23 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.68 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.32 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  33.19 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  34.66 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  35.27 
 
 		 461 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  33.87 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  34.64 
 
 		 466 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  33.05 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.82 
 
 		 474 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  37.03 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  33.63 
 
 		 476 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.01 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.31 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  34.29 
 
 		 469 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  33.11 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.87 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 		 461 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 469 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  34.6 
 
 		 460 aa  229  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  36.26 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.9 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.78 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  34.07 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.07 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.94 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.07 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  34.14 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  34.07 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.65 
 
 		 447 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  34.07 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  34.07 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.86 
 
 		 453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  34.07 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.8 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.92 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  33.89 
 
 		 459 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  36.55 
 
 		 455 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.11 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  34.55 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  35.18 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.09 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.51 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.87 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  37.14 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  33.63 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  34.57 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 472 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>