More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1281 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1281  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
444 aa  874    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.666679  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2089  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  76.52 
 
 
444 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.491336 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  85.29 
 
 
442 aa  733    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.409643  hitchhiker  0.000186783 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1218  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.55 
 
 
459 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.126546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.04 
 
 
460 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40 
 
 
467 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 
455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  39.29 
 
 
460 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  37.23 
 
 
466 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  36.06 
 
 
452 aa  252  9.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.94 
 
 
470 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  38.27 
 
 
461 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  35.75 
 
 
474 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  35.73 
 
 
466 aa  249  7e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  34.42 
 
 
470 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  35.53 
 
 
474 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  34.42 
 
 
470 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.31 
 
 
478 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.2 
 
 
470 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.2 
 
 
470 aa  247  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  34.42 
 
 
470 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.94 
 
 
461 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.92 
 
 
459 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.42 
 
 
470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.18 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.42 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  35.1 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.09 
 
 
461 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.34 
 
 
464 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.77 
 
 
470 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  34.97 
 
 
476 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  36.22 
 
 
459 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.77 
 
 
460 aa  243  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  38.66 
 
 
467 aa  242  9e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.55 
 
 
460 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.55 
 
 
460 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.56 
 
 
470 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.26 
 
 
470 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 
473 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  34.44 
 
 
459 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 
457 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  35.18 
 
 
473 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.3 
 
 
474 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 
457 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.73 
 
 
457 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  35.99 
 
 
459 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 
474 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  36.73 
 
 
461 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.99 
 
 
460 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  35.09 
 
 
461 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 
474 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.41 
 
 
471 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.1 
 
 
459 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.63 
 
 
464 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  32.96 
 
 
459 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  35.53 
 
 
474 aa  236  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.36 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  35.45 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  35.31 
 
 
499 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 
453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.12 
 
 
456 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  34.37 
 
 
472 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 
470 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  36.1 
 
 
462 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  35.01 
 
 
472 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.49 
 
 
462 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.29 
 
 
460 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  34.8 
 
 
460 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0673  FAD linked oxidase domain protein  34.29 
 
 
483 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  36.1 
 
 
462 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.16 
 
 
447 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  35.59 
 
 
447 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  31.32 
 
 
456 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  34.74 
 
 
495 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 
462 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  35.45 
 
 
472 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.92 
 
 
469 aa  229  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  36.69 
 
 
461 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  36.69 
 
 
461 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34 
 
 
473 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.2 
 
 
477 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  33.95 
 
 
462 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  35.41 
 
 
469 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  31.53 
 
 
460 aa  228  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  37.62 
 
 
455 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 
458 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 
472 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 
461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 
462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.41 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  37.75 
 
 
481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 
453 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.18 
 
 
460 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 
474 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  32.97 
 
 
473 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.56 
 
 
460 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  33.26 
 
 
459 aa  225  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.92 
 
 
484 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 
469 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 
469 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>