More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2089 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2089  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 444 aa  877    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.491336 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  76.52 
 
 		 442 aa  660    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.409643  hitchhiker  0.000186783 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1281  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.52 
 
 		 444 aa  651    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.666679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1218  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51 
 
 		 459 aa  408  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.126546 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1344  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.02 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.230995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.24 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  38 
 
 		 470 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  36.89 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  36.89 
 
 		 470 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2178  FAD linked oxidase domain protein  38.28 
 
 		 452 aa  269  8e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.393978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  36.67 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.67 
 
 		 470 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  36.67 
 
 		 470 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.67 
 
 		 470 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.3 
 
 		 466 aa  265  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  38.05 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.22 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.94 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.44 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  36 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 		 466 aa  262  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.71 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.99 
 
 		 459 aa  257  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  36.41 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  35.84 
 
 		 472 aa  252  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  36.91 
 
 		 460 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  35.57 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  34.5 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  34.3 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.41 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  36.04 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0193  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.1 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.966157  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 456 aa  243  7e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.32 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2154  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.56 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  33.65 
 
 		 460 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.67 
 
 		 460 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.43 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  35.78 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 		 457 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 		 457 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.43 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.24 
 
 		 457 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.22 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  35.04 
 
 		 462 aa  239  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.76 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.74 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.36 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.93 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  35.75 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  35.16 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  36.52 
 
 		 473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  34.93 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.07 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  33.12 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.01 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.31 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  34.49 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0182  oxidoreductase, FAD-binding  37.91 
 
 		 467 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1878  D-lactate dehydrogenase  36.54 
 
 		 461 aa  232  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.27 
 
 		 456 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  35.62 
 
 		 472 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.14 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0352  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.56 
 
 		 469 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  31.81 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.11 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  35.86 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  34.87 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1801  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.51 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00393033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  34.81 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.01 
 
 		 473 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.87 
 
 		 459 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  35.31 
 
 		 495 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 473 aa  230  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  35.65 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  35.87 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.9 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  35.17 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  35.29 
 
 		 462 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.21 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  35.43 
 
 		 462 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.5 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1118  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.47 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.410973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.44 
 
 		 475 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.5 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.41 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  34.13 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  32.17 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.32 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.65 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  34.2 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>