More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0064 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  77.43 
 
 		 470 aa  769    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  80.8 
 
 		 474 aa  778    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 474 aa  971    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  78.69 
 
 		 474 aa  792    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  81.01 
 
 		 474 aa  781    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  75.32 
 
 		 474 aa  763    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  77.85 
 
 		 473 aa  782    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  64.77 
 
 		 471 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  64.48 
 
 		 495 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  69.02 
 
 		 499 aa  681    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  64.56 
 
 		 471 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  69.41 
 
 		 473 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  75.53 
 
 		 473 aa  767    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  81.43 
 
 		 474 aa  811    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  64.9 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.69 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.9 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  64.08 
 
 		 472 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.48 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.69 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  64.05 
 
 		 476 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.15 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  63.24 
 
 		 472 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  63.24 
 
 		 472 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  66.08 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.47 
 
 		 485 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  63.8 
 
 		 469 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  63.72 
 
 		 469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  62.9 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.67 
 
 		 488 aa  538  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.94 
 
 		 477 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.75 
 
 		 470 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.93 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.44 
 
 		 464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  56.21 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.81 
 
 		 467 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.81 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  53.81 
 
 		 468 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.16 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  53.32 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.63 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  53.26 
 
 		 473 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  54.96 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  53.14 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  54.76 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.45 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.45 
 
 		 497 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  53.67 
 
 		 497 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.67 
 
 		 497 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.45 
 
 		 497 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.45 
 
 		 497 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  53.5 
 
 		 472 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  53.45 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  54.57 
 
 		 468 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.89 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.22 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.26 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.88 
 
 		 457 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.77 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  52.17 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  52.6 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  51 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  50.88 
 
 		 456 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.6 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.53 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  52.53 
 
 		 460 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.48 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  52.43 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.1 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.69 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.17 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  48.16 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  47.93 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  48.16 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  47.93 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  47.93 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.85 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  47.93 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  48.39 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  47.48 
 
 		 463 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  47.71 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.9 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0144  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.78 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  46.15 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  46.8 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  43.36 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  42.51 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  43.57 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  42.86 
 
 		 601 aa  352  8.999999999999999e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  42.44 
 
 		 474 aa  346  6e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  39.37 
 
 		 565 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  41.55 
 
 		 560 aa  326  6e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.77 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>