More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1651 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  70.26 
 
 
456 aa  650    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
461 aa  932    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.98 
 
 
457 aa  548  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.91 
 
 
475 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.95 
 
 
466 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  43.71 
 
 
466 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  40.92 
 
 
466 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  40.39 
 
 
459 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 
472 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  40.61 
 
 
461 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  42.3 
 
 
459 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.09 
 
 
459 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  42.3 
 
 
459 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  40.09 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.87 
 
 
470 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.87 
 
 
470 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.04 
 
 
470 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.31 
 
 
469 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.87 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.09 
 
 
470 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 
470 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.65 
 
 
470 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.43 
 
 
470 aa  329  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.43 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.19 
 
 
464 aa  323  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  35.25 
 
 
456 aa  322  8e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  39.91 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.43 
 
 
459 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.91 
 
 
459 aa  319  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.2 
 
 
460 aa  318  9e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.35 
 
 
464 aa  315  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.32 
 
 
460 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.44 
 
 
462 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.83 
 
 
459 aa  310  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  36.34 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  38.34 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  37.91 
 
 
457 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.31 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  40 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.36 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.36 
 
 
460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  37.61 
 
 
461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  37.36 
 
 
460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 
470 aa  303  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  36.6 
 
 
457 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.15 
 
 
462 aa  300  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  37.05 
 
 
461 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  38.78 
 
 
453 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.73 
 
 
457 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 
485 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  36.72 
 
 
483 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.6 
 
 
460 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  37.74 
 
 
461 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  38.28 
 
 
466 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.61 
 
 
473 aa  295  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2013  FAD linked oxidase domain protein  38.58 
 
 
464 aa  295  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.59 
 
 
459 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  38.06 
 
 
466 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  36.44 
 
 
462 aa  291  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  38.21 
 
 
472 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0269  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.69 
 
 
467 aa  290  3e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000254872  hitchhiker  0.000000323322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 
469 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  38.02 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  38.16 
 
 
471 aa  289  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  37.73 
 
 
503 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 
469 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.58 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  35.08 
 
 
460 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 
471 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  37.89 
 
 
452 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.31 
 
 
484 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.8 
 
 
469 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  37.77 
 
 
472 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.76 
 
 
494 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.69 
 
 
890 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2214  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
464 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.196928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.98 
 
 
476 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.02 
 
 
469 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  36.84 
 
 
495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.04 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3919  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.12 
 
 
493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.48 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  37.64 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.62 
 
 
495 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.62 
 
 
495 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.05 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.31 
 
 
887 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.75 
 
 
486 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  37.77 
 
 
472 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  39.15 
 
 
461 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.44 
 
 
464 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  37.39 
 
 
473 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 
473 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.44 
 
 
493 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  36.32 
 
 
460 aa  280  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  35.75 
 
 
469 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>