More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1299 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
456 aa  917    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.19 
 
 
488 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.71 
 
 
467 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  58.07 
 
 
495 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  57.24 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  56.39 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  56.36 
 
 
472 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  55.29 
 
 
471 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  57.08 
 
 
476 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.51 
 
 
485 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  55.92 
 
 
472 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.95 
 
 
469 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.17 
 
 
469 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.75 
 
 
469 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.51 
 
 
469 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  55.95 
 
 
469 aa  525  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.17 
 
 
469 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.44 
 
 
464 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.73 
 
 
469 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  57.14 
 
 
462 aa  519  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  56.73 
 
 
469 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  55.9 
 
 
452 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  55.75 
 
 
468 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  54.99 
 
 
465 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  56.19 
 
 
465 aa  508  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  55.61 
 
 
469 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  55.29 
 
 
478 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  55.73 
 
 
499 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.77 
 
 
470 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.32 
 
 
470 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  53.1 
 
 
473 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  53.66 
 
 
469 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  53.36 
 
 
474 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.11 
 
 
470 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.99 
 
 
474 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.63 
 
 
475 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.85 
 
 
473 aa  491  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.54 
 
 
492 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  55.9 
 
 
457 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.12 
 
 
457 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.66 
 
 
474 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.55 
 
 
473 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.61 
 
 
477 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.83 
 
 
497 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.61 
 
 
497 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  54.61 
 
 
497 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.61 
 
 
497 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.19 
 
 
477 aa  481  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  50.66 
 
 
474 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.61 
 
 
497 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  54.61 
 
 
497 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.23 
 
 
457 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  54.77 
 
 
473 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  56.11 
 
 
472 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  54.98 
 
 
472 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.1 
 
 
470 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  53.22 
 
 
474 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.88 
 
 
474 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.53 
 
 
484 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  53.22 
 
 
474 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  53.44 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  54.42 
 
 
468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  53.96 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  53.71 
 
 
460 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.41 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  54.41 
 
 
475 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.48 
 
 
460 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.27 
 
 
459 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.56 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0144  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.36 
 
 
450 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.65 
 
 
482 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45.66 
 
 
463 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  45.88 
 
 
463 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  46.01 
 
 
463 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.47 
 
 
461 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  46.01 
 
 
463 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  46.01 
 
 
463 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  48.52 
 
 
453 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 
463 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  45.21 
 
 
463 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  46.59 
 
 
454 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  46.24 
 
 
463 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45.11 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  45.33 
 
 
463 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.22 
 
 
457 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.66 
 
 
447 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  43.92 
 
 
457 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  42.61 
 
 
601 aa  362  9e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_55040  d-lactate dehydrogenase  43.41 
 
 
506 aa  355  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  43.79 
 
 
560 aa  354  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  43.3 
 
 
447 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2410  FAD linked oxidase-like  44.1 
 
 
474 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06950  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein, putative  41.9 
 
 
565 aa  325  7e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.06 
 
 
473 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>