More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23292 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  100 
 
 
572 aa  1189    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  47.14 
 
 
483 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  24.24 
 
 
439 aa  130  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  32.59 
 
 
437 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  25.38 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.94 
 
 
409 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  29.46 
 
 
460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  26.84 
 
 
437 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  25.53 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  31.74 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  25.92 
 
 
436 aa  112  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  25.2 
 
 
452 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  25.56 
 
 
441 aa  109  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  28.63 
 
 
435 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  24.34 
 
 
473 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  30.99 
 
 
438 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  28.57 
 
 
428 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  23.63 
 
 
438 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  27.64 
 
 
423 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  24.14 
 
 
425 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  31.74 
 
 
437 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29 
 
 
447 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  25.88 
 
 
469 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.63 
 
 
427 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  28.8 
 
 
574 aa  95.9  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  27.03 
 
 
412 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  23.89 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  28.88 
 
 
434 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  30.04 
 
 
432 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  28.46 
 
 
486 aa  94.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  26.67 
 
 
434 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  25.5 
 
 
438 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  23.26 
 
 
437 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  22.8 
 
 
437 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  25.33 
 
 
437 aa  90.5  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
437 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  22.8 
 
 
437 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  22.8 
 
 
437 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  20.17 
 
 
556 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.65 
 
 
445 aa  89.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  22.96 
 
 
470 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  22.8 
 
 
437 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  22.8 
 
 
437 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  26.17 
 
 
437 aa  88.6  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  28.28 
 
 
448 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  24.18 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  26.14 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.29 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  28 
 
 
415 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  25.58 
 
 
442 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  24.56 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.07 
 
 
437 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  24.83 
 
 
439 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.5 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26 
 
 
415 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  23.46 
 
 
464 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  32.22 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  26.82 
 
 
440 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.53 
 
 
429 aa  72  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  22.87 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  20.82 
 
 
504 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  23.38 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  27.32 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  24.81 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  29.07 
 
 
484 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  25.41 
 
 
424 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  25.65 
 
 
464 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  25.41 
 
 
468 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.28 
 
 
462 aa  63.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.56 
 
 
500 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  29.7 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25.41 
 
 
478 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  29.07 
 
 
499 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.75 
 
 
490 aa  60.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.74 
 
 
478 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.86 
 
 
478 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.21 
 
 
496 aa  60.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  27.33 
 
 
499 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.32 
 
 
471 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  24.32 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.87 
 
 
481 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  27.33 
 
 
499 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.32 
 
 
478 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  27.33 
 
 
499 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  24.32 
 
 
478 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.49 
 
 
501 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.32 
 
 
471 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  27.37 
 
 
476 aa  57  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  27.91 
 
 
503 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  27.91 
 
 
499 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.67 
 
 
761 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  27.91 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  25.18 
 
 
461 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>