64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1781 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  100 
 
 
642 aa  1336    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  24.14 
 
 
486 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  22.74 
 
 
437 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  22.69 
 
 
437 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  22.74 
 
 
437 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  22.33 
 
 
437 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  23.35 
 
 
447 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  22.13 
 
 
437 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  22.87 
 
 
437 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  22.87 
 
 
434 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  23.41 
 
 
432 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  22.54 
 
 
437 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  22.13 
 
 
437 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  22.62 
 
 
438 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  23.41 
 
 
428 aa  102  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  23.51 
 
 
441 aa  101  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  22.62 
 
 
427 aa  99.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  24.81 
 
 
433 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  21.44 
 
 
437 aa  94.7  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  22.28 
 
 
435 aa  94  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  22.1 
 
 
442 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.64 
 
 
437 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  22.28 
 
 
464 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  21.47 
 
 
439 aa  90.5  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  22.96 
 
 
464 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  21.02 
 
 
445 aa  90.1  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  21.85 
 
 
434 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.47 
 
 
445 aa  87.4  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  21.12 
 
 
425 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  23.83 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  22.57 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  22.65 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  24.48 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  22.76 
 
 
437 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  22.99 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  26.32 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  24.08 
 
 
412 aa  76.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  22.93 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  21.53 
 
 
475 aa  73.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  22.48 
 
 
469 aa  71.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  22.96 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.84 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  23.51 
 
 
411 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  20.81 
 
 
429 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  23.04 
 
 
417 aa  64.3  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  24.28 
 
 
415 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  21.92 
 
 
439 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  26.16 
 
 
415 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  25.11 
 
 
574 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  24.15 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25.32 
 
 
415 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  24.46 
 
 
424 aa  58.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  22.45 
 
 
470 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  21.24 
 
 
437 aa  54.7  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25 
 
 
556 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  21.53 
 
 
460 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  20.69 
 
 
473 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  23.53 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
376 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  24.5 
 
 
418 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  21.43 
 
 
572 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.81 
 
 
504 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  35.38 
 
 
246 aa  44.3  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  19.35 
 
 
448 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>