102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2461 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 446 aa  894    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  50.32 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.23 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  46.14 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  43.23 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  47.17 
 
 		 427 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  40.71 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  45.54 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.66 
 
 		 417 aa  312  9e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  44.68 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  46.21 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  42.99 
 
 		 421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  41.57 
 
 		 413 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  38.26 
 
 		 429 aa  279  8e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 		 424 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  40.51 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  30.55 
 
 		 441 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  30.94 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  26.85 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  29.85 
 
 		 438 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  26.36 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  27.44 
 
 		 460 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  30.43 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  27.35 
 
 		 424 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  31.59 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  28.95 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  25.89 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  30.43 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  28.47 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.06 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  26.83 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  24.55 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  23.61 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  27.47 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  27.63 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  25.72 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  28.31 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  26.73 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  27.44 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  27.29 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  27.55 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.86 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  22.86 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  27.45 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  26.86 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  26.39 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  25.84 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  26.56 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  27.46 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  24.55 
 
 		 417 aa  98.2  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  22.54 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  22.77 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  25.74 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  26.45 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  22.32 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 409 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  21.57 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  21.06 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  21.12 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  20.67 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  20.67 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  25.18 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  20.45 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  24.72 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.11 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  33 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  23.83 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.5 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  32.59 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  30.08 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.77 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  26.5 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.07 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  23.02 
 
 		 556 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  28.31 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  18.54 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  30.36 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  28.05 
 
 		 761 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  23.97 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  23.97 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  20.31 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  38.98 
 
 		 246 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.26 
 
 		 468 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  24.26 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  24.68 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  30.48 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  22.42 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  35.71 
 
 		 69 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  23.36 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  27.21 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.74 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  23.53 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  23.53 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2272  hypothetical protein  29.91 
 
 		 642 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  23.53 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.57 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.38 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>