74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5285 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 366 aa  760    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  36.47 
 
 		 539 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  27.49 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  27.7 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  29.27 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  29.44 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  27.52 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  27.31 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  29.94 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  26.47 
 
 		 445 aa  72.8  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  26.48 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  23.53 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.23 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  29.65 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  31.68 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  26.24 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.96 
 
 		 642 aa  68.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  28.24 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  26.72 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  28.68 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  28.68 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  28.68 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  28.68 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  23.92 
 
 		 425 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  27.13 
 
 		 434 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  27.91 
 
 		 437 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  28.72 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  26.52 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  24.75 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.27 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.42 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  27.91 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  26.36 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  22.17 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  26.84 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  28.34 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  27.23 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  25.25 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  27.04 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  27.57 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  25.95 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.12 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  34.09 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  27.57 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  25.14 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  27.86 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  27.36 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  27.67 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  24.27 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  23.37 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  26.52 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25.67 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 		 424 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  23.3 
 
 		 464 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  27.43 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  25.89 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.32 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.91 
 
 		 409 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  28.29 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.23 
 
 		 483 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  33.61 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  22.39 
 
 		 469 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  27.66 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  25.79 
 
 		 421 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.47 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  23.94 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  21.36 
 
 		 572 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>