209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2981 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 440 aa  908    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  44.52 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  41.74 
 
 		 442 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  41.51 
 
 		 464 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  41.69 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  39.55 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  40.6 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  36.84 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  36.79 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  38.72 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  40.27 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  41.01 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  36.3 
 
 		 437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  37.3 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  38.69 
 
 		 437 aa  289  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  35.76 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  37.21 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  38.58 
 
 		 423 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  36.53 
 
 		 437 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  36.45 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  37.6 
 
 		 486 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  35.54 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  36.22 
 
 		 437 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  36.07 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  38.78 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  35.76 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  35.76 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  39.09 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  37.56 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  37.22 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  35.6 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  34.91 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  37.41 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  33.56 
 
 		 411 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  37.44 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  35.12 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  39.31 
 
 		 466 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  36.76 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  33.71 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  34.43 
 
 		 473 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  34.32 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.73 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  36.07 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  36.07 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  35.84 
 
 		 415 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  36 
 
 		 438 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  35.62 
 
 		 427 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  34.16 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  34.15 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  33.55 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  28.19 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.8 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  28.92 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 		 437 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  29.35 
 
 		 418 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.16 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.35 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  28.88 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  27.95 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  28.45 
 
 		 423 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.06 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.31 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  23.15 
 
 		 574 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  29.26 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  26.82 
 
 		 572 aa  93.2  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  27.56 
 
 		 246 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  25 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  28.49 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  31.51 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  25.2 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  25.57 
 
 		 761 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.86 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.29 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  19.33 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  19.33 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  19.33 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.93 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  19.91 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  18.89 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  26.28 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  19.55 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  19.55 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 378 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  25.83 
 
 		 539 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.08 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  19.1 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  20.04 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  26.77 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.49 
 
 		 642 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>