More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2367 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
440 aa  897    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  71.33 
 
 
443 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 
454 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  36.52 
 
 
424 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  29.85 
 
 
437 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  31.18 
 
 
431 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 
437 aa  193  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  28.76 
 
 
444 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  27.8 
 
 
440 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  31.04 
 
 
421 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  31.78 
 
 
409 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  32.93 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.65 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  28.77 
 
 
425 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  32.68 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
395 aa  160  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 
428 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  40.91 
 
 
395 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 
427 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.38 
 
 
407 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.79 
 
 
404 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.14 
 
 
450 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.67 
 
 
887 aa  147  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  28.97 
 
 
436 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  31.88 
 
 
411 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  30.26 
 
 
452 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  38.99 
 
 
437 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  41.36 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  27.29 
 
 
426 aa  136  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.96 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.62 
 
 
890 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.65 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.93 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.93 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.04 
 
 
470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  36.32 
 
 
470 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  36.32 
 
 
470 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  35.85 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  27.42 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.7 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.7 
 
 
470 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  26.84 
 
 
411 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  35.85 
 
 
470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  39.79 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.93 
 
 
876 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.83 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.93 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.64 
 
 
405 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.93 
 
 
460 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.93 
 
 
460 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  37.79 
 
 
399 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 
457 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  26.25 
 
 
399 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.36 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.02 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  39.68 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  26.94 
 
 
410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  27.51 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1608  FAD linked oxidase-like protein  30.03 
 
 
468 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319346  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.23 
 
 
370 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.1 
 
 
459 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.23 
 
 
370 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  27.46 
 
 
466 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.92 
 
 
459 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.75 
 
 
467 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.48 
 
 
475 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.33 
 
 
390 aa  119  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  35.83 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.68 
 
 
458 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.68 
 
 
358 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  25.99 
 
 
472 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 
464 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.64 
 
 
403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.36 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  34.85 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.55 
 
 
362 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  30.36 
 
 
470 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.8 
 
 
374 aa  117  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.95 
 
 
352 aa  116  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
357 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3310  FAD linked oxidase domain protein  29.72 
 
 
470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000594677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.02 
 
 
349 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.7 
 
 
392 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.09 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.33 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  33.33 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 
396 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  25.68 
 
 
461 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  38.05 
 
 
471 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.38 
 
 
382 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 
462 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.66 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  27.25 
 
 
459 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.37 
 
 
404 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.36 
 
 
372 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  30.06 
 
 
470 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 
353 aa  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.1 
 
 
352 aa  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>