More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2054 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
444 aa  909    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  56.91 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.09 
 
 
437 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  49.43 
 
 
440 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  48.97 
 
 
440 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  49.2 
 
 
437 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 
454 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  41.85 
 
 
425 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  31.83 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  32.17 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  28.76 
 
 
440 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  35.47 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  32.76 
 
 
421 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.28 
 
 
404 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  34.46 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  33.67 
 
 
395 aa  180  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  29.44 
 
 
436 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 
428 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  33.5 
 
 
399 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.01 
 
 
407 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  30.02 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  31.3 
 
 
411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  29.93 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  32.09 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  32.6 
 
 
460 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.56 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  40.23 
 
 
383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.68 
 
 
427 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.89 
 
 
379 aa  160  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  42.31 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  29.48 
 
 
474 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  30.33 
 
 
473 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  29.56 
 
 
471 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.62 
 
 
469 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 
471 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.31 
 
 
485 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.3 
 
 
474 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  27.42 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.42 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  27.42 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.19 
 
 
469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.19 
 
 
469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.19 
 
 
469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.19 
 
 
469 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  27.57 
 
 
495 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  27.61 
 
 
399 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.22 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  28.6 
 
 
472 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  31.07 
 
 
362 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.61 
 
 
476 aa  136  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.74 
 
 
474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.76 
 
 
887 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  27.55 
 
 
456 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.63 
 
 
876 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.36 
 
 
405 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  26.68 
 
 
472 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.13 
 
 
474 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  27.02 
 
 
472 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  28.13 
 
 
474 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  25.99 
 
 
454 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.79 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.59 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 
469 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.56 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  26.87 
 
 
399 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  38.71 
 
 
399 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.29 
 
 
466 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.71 
 
 
469 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.06 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.53 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  24.84 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.71 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  31.47 
 
 
469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.71 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  32.82 
 
 
452 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.82 
 
 
469 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.82 
 
 
469 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.93 
 
 
464 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 
357 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  27.16 
 
 
461 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.47 
 
 
460 aa  126  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  25.22 
 
 
459 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  24.89 
 
 
474 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  25 
 
 
459 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  23.82 
 
 
459 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  23.94 
 
 
460 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 
392 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.73 
 
 
459 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  26.78 
 
 
499 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.55 
 
 
482 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.84 
 
 
457 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.15 
 
 
477 aa  124  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  25.12 
 
 
472 aa  124  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.28 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  27.82 
 
 
473 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.57 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.34 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  25.97 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>