More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4556 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  100 
 
 
431 aa  875    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.42 
 
 
437 aa  596  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  56.91 
 
 
444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  53.17 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  51.72 
 
 
440 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  51.23 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  47.28 
 
 
454 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  43.99 
 
 
425 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  38.25 
 
 
395 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  36.74 
 
 
424 aa  219  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  37.8 
 
 
421 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 
450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  34.34 
 
 
409 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 
409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  31.18 
 
 
440 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
404 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  29.86 
 
 
426 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  36.66 
 
 
411 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.33 
 
 
428 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.25 
 
 
427 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  32.06 
 
 
443 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  30.85 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  32.84 
 
 
460 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  33.9 
 
 
399 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 
399 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  32.24 
 
 
395 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.5 
 
 
379 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  39.74 
 
 
437 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.44 
 
 
407 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 
411 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  34.13 
 
 
383 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.93 
 
 
887 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.29 
 
 
482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.8 
 
 
876 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 
392 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  26.74 
 
 
452 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  29 
 
 
499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.59 
 
 
459 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 
472 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  27.05 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 
472 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  27.86 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  33.69 
 
 
471 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.61 
 
 
485 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.18 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  27.9 
 
 
472 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  27.76 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  25.93 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  28 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 
471 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.46 
 
 
459 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.53 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.42 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.71 
 
 
470 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.53 
 
 
492 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.27 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  26.93 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  31.32 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  32.93 
 
 
452 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  26.82 
 
 
474 aa  127  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.67 
 
 
474 aa  126  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.68 
 
 
410 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  26.24 
 
 
495 aa  126  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.8 
 
 
357 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.93 
 
 
469 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  26.79 
 
 
462 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 
469 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.13 
 
 
488 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.49 
 
 
457 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 
469 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  37.19 
 
 
466 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.08 
 
 
447 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  27.21 
 
 
474 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  34.47 
 
 
362 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  30.11 
 
 
469 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  30.11 
 
 
469 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  30.11 
 
 
469 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  27.53 
 
 
473 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  27.79 
 
 
476 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  35.32 
 
 
466 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  26.42 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  29.75 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.75 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.75 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  29.75 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.11 
 
 
459 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  26.18 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  27.63 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.45 
 
 
473 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.5 
 
 
470 aa  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  35.24 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  27.79 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  33.33 
 
 
457 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 
396 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  25.22 
 
 
457 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>