More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4800 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
395 aa  745    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  49.12 
 
 
424 aa  309  6.999999999999999e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  39.55 
 
 
421 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  46.9 
 
 
411 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  43.93 
 
 
437 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.39 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  38.5 
 
 
431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.23 
 
 
450 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.95 
 
 
437 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.91 
 
 
404 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  32.49 
 
 
437 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  43.29 
 
 
399 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  43.41 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  43.28 
 
 
409 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  32.67 
 
 
444 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  37.21 
 
 
425 aa  209  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  43.14 
 
 
409 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  33.98 
 
 
454 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  30.9 
 
 
440 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  30.9 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  37.25 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  39.4 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.22 
 
 
428 aa  183  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  35.48 
 
 
395 aa  183  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  32.05 
 
 
443 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  33.5 
 
 
426 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  33 
 
 
440 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.46 
 
 
427 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.63 
 
 
379 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.94 
 
 
887 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.37 
 
 
460 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  32.38 
 
 
383 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.87 
 
 
876 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  29.01 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  40.55 
 
 
362 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.79 
 
 
457 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.5 
 
 
482 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  34.56 
 
 
456 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.38 
 
 
890 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.57 
 
 
357 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.38 
 
 
403 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.58 
 
 
358 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.13 
 
 
399 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  26.95 
 
 
489 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.97 
 
 
459 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  34.58 
 
 
452 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.21 
 
 
464 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  35.35 
 
 
466 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  35.35 
 
 
466 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  30.05 
 
 
410 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 
405 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 
454 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08317  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17520)  33.02 
 
 
560 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.900406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  30.81 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  34.56 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  40.26 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1651  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.4 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  38.03 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.03 
 
 
460 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 
497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.68 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  36.87 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  32.73 
 
 
497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  31.44 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  33.03 
 
 
459 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 
477 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  30.3 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.1 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  41.62 
 
 
457 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.73 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 
458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  33.03 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  30.86 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.9 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  31.34 
 
 
475 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.79 
 
 
476 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.02 
 
 
461 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.78 
 
 
473 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  32.73 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  29.85 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  37.33 
 
 
473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2705  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.62 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  40.31 
 
 
469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.33 
 
 
473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  33.49 
 
 
459 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.16 
 
 
461 aa  116  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2989  FAD linked oxidase-like  37.69 
 
 
477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.53 
 
 
462 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  34.65 
 
 
462 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  35.62 
 
 
453 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 
481 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.99 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2875  FAD linked oxidase domain protein  40.21 
 
 
474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  32.26 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>