More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0681 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
399 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  44.86 
 
 
411 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  42.69 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.24 
 
 
407 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.76 
 
 
450 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  41.77 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  40.54 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  33.91 
 
 
421 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40.06 
 
 
379 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  35.1 
 
 
431 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.25 
 
 
437 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  39.68 
 
 
411 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  34.09 
 
 
425 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.19 
 
 
404 aa  156  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  51.61 
 
 
409 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  51.61 
 
 
409 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  50.54 
 
 
409 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 
454 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.41 
 
 
428 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.01 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  29.31 
 
 
440 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  30.88 
 
 
444 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  29.06 
 
 
440 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  33.51 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  42.22 
 
 
443 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  32.49 
 
 
436 aa  126  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  37.79 
 
 
440 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.36 
 
 
357 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 
404 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  36.97 
 
 
363 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.35 
 
 
355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 
362 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  40.19 
 
 
368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.54 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  29.32 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.69 
 
 
876 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.21 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  40 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  40 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.79 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  40 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.52 
 
 
354 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  41.53 
 
 
369 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.53 
 
 
369 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.01 
 
 
358 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.64 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.92 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.45 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.17 
 
 
360 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.92 
 
 
362 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.56 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  36.62 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.81 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.84 
 
 
362 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.01 
 
 
356 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.76 
 
 
362 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  42.44 
 
 
358 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.49 
 
 
355 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.57 
 
 
372 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.56 
 
 
358 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  35.87 
 
 
466 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.72 
 
 
370 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.72 
 
 
370 aa  106  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.86 
 
 
358 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.97 
 
 
359 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.59 
 
 
374 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 
410 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.45 
 
 
405 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.56 
 
 
348 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.96 
 
 
350 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.97 
 
 
359 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  33.97 
 
 
351 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  33.18 
 
 
459 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  42.95 
 
 
402 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.36 
 
 
376 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.19 
 
 
350 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  46.75 
 
 
368 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  30.3 
 
 
416 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.9 
 
 
352 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.34 
 
 
350 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  31.83 
 
 
410 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.15 
 
 
351 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  35.94 
 
 
412 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  44.09 
 
 
352 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  26.61 
 
 
459 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  32.08 
 
 
459 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  30.17 
 
 
413 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.3 
 
 
377 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.76 
 
 
377 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.03 
 
 
375 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  44.07 
 
 
441 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.46 
 
 
367 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.4 
 
 
382 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  30.19 
 
 
460 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.61 
 
 
350 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2501  FAD linked oxidase-like  48.33 
 
 
363 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.18 
 
 
358 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  32.16 
 
 
383 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>