More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0157 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  100 
 
 		 383 aa  761    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  64.05 
 
 		 399 aa  501  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  55.33 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  38.56 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 		 440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  34.65 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  40.23 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  34.13 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.61 
 
 		 437 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.45 
 
 		 450 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.34 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  33.68 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  35.37 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  35.41 
 
 		 409 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  31.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.98 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  32.59 
 
 		 412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  32.6 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  34.59 
 
 		 409 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  40.43 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  30.81 
 
 		 411 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.32 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  30.48 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  31.67 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.07 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  29.92 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.84 
 
 		 404 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  31.83 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  27.32 
 
 		 440 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  33.65 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  30.42 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  30.66 
 
 		 452 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  32.72 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  40.83 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.29 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.83 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  31.74 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.54 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  38.97 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.34 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  30.28 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.57 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  32.16 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.25 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  30.25 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.61 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.61 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.84 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.74 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.31 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.31 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.31 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.49 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  29.97 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.86 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.43 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.97 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.97 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.7 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  36.46 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.43 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.77 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.07 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  31 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  28.95 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.29 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.04 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.42 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  27.67 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.33 
 
 		 887 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  36.98 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  36.55 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  29.72 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  30 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  36.98 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.52 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.33 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  36.98 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  38.6 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.32 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  39.64 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.61 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  31.32 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.84 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.83 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  36.46 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.11 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.46 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.46 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  36.46 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>