More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0480 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  100 
 
 		 390 aa  775    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  69.39 
 
 		 382 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.36 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.59 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  58.59 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.76 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.29 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  53.59 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.96 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  61.14 
 
 		 368 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.7 
 
 		 376 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  58.64 
 
 		 368 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.66 
 
 		 362 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.86 
 
 		 362 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.86 
 
 		 362 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.86 
 
 		 362 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.13 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.13 
 
 		 362 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.69 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.72 
 
 		 362 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.01 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.93 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.66 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.82 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.91 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.61 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  50 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.2 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.78 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.93 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.75 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.66 
 
 		 356 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.87 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  49.87 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  47.91 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  50.13 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.77 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.74 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.26 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.3 
 
 		 350 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.21 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.69 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.56 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.65 
 
 		 350 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.3 
 
 		 359 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.54 
 
 		 354 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.04 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  42.04 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.04 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  42.04 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.78 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.97 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.21 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.56 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.78 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.51 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.89 
 
 		 355 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  43.83 
 
 		 352 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.18 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.39 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.13 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.04 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.12 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.63 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.6 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.56 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1782  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.81 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.56 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.96 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1500  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.3 
 
 		 353 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.914379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  37.47 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  39.85 
 
 		 401 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  36.96 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.72 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.8 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  36.67 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  35.79 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  39.63 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  36.51 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  34.99 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  34.16 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.12 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  36.52 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  34.91 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  34.08 
 
 		 413 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  39.63 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2501  FAD linked oxidase-like  39.52 
 
 		 363 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.26 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1893  FAD linked oxidase domain protein  40.99 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.42 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>