More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3314 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  100 
 
 
349 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  63.53 
 
 
356 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  59.34 
 
 
367 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  58.4 
 
 
367 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.25 
 
 
362 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.25 
 
 
362 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.8 
 
 
362 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.42 
 
 
362 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.97 
 
 
362 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.97 
 
 
362 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.97 
 
 
362 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.7 
 
 
362 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  54.42 
 
 
362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  58.74 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  53.85 
 
 
356 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.8 
 
 
362 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  53.72 
 
 
377 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.52 
 
 
362 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.25 
 
 
362 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.12 
 
 
376 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  53.44 
 
 
364 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.62 
 
 
377 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  55.56 
 
 
368 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.62 
 
 
372 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.81 
 
 
370 aa  332  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.53 
 
 
370 aa  330  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  52.87 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  52.16 
 
 
376 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.01 
 
 
350 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.15 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.64 
 
 
404 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.59 
 
 
351 aa  318  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.15 
 
 
350 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.07 
 
 
422 aa  316  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.91 
 
 
390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.25 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.15 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.44 
 
 
359 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  51.58 
 
 
350 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  52.44 
 
 
359 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.13 
 
 
382 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  52.39 
 
 
368 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 
375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.56 
 
 
350 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.99 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  51.76 
 
 
369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.76 
 
 
369 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.28 
 
 
350 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.28 
 
 
350 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  48.28 
 
 
350 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  47.99 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.99 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  50.43 
 
 
351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  48.85 
 
 
352 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.58 
 
 
355 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.46 
 
 
355 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.76 
 
 
358 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.13 
 
 
352 aa  295  8e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.13 
 
 
374 aa  295  8e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.99 
 
 
352 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.41 
 
 
355 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  48.17 
 
 
358 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.19 
 
 
360 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.91 
 
 
360 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.22 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.13 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.27 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  55.33 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1500  glycolate oxidase FAD binding subunit  56.51 
 
 
353 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.914379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.29 
 
 
354 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.83 
 
 
362 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1782  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.29 
 
 
381 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1893  FAD linked oxidase domain protein  40.69 
 
 
370 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  39.3 
 
 
381 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.03 
 
 
410 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  38.29 
 
 
401 aa  202  6e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.82 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.01 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  41.11 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  38.48 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  34.75 
 
 
413 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  40.2 
 
 
410 aa  189  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  38.81 
 
 
405 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.89 
 
 
396 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  37.76 
 
 
399 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  35.25 
 
 
413 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  38.08 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.24 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2895  hypothetical protein  41.76 
 
 
378 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.510368  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  34 
 
 
416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  36.73 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  34.26 
 
 
413 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.04 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>