More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1893 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1893  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 370 aa  731    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.5 
 
 		 350 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.51 
 
 		 350 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  46.28 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.23 
 
 		 350 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  44.29 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.79 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.1 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.09 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.06 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.18 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.34 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.42 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.06 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.88 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.88 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  42 
 
 		 350 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  42 
 
 		 350 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  42 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.98 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.98 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.98 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.95 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.71 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.95 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  41.71 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.98 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.94 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.54 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.43 
 
 		 350 aa  246  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.26 
 
 		 350 aa  246  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.7 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.14 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.82 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0960  FAD linked oxidase  44.86 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.58 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.97 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1500  glycolate oxidase FAD binding subunit  47.77 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.914379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.7 
 
 		 377 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.58 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.61 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.9 
 
 		 362 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.97 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  43.22 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.62 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.96 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  41.23 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.01 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  41.48 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.7 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.86 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.93 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.11 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.94 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2413  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.69 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0330  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.7 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3331  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.602034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.34 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.46 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3303  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.03 
 
 		 358 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.625485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.37 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0222  glycolate oxidase FAD binding subunit  45.02 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1895  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.61 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.69 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.72 
 
 		 364 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  42.17 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.17 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.44 
 
 		 404 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.52 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.58 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.99 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0223  FAD linked oxidase domain protein  42.99 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3312  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.62 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1782  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.49 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  31.08 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 		 399 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  35.39 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0992  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.45 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137928  normal  0.200899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  31 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  35.45 
 
 		 395 aa  135  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  32.09 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.85 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.85 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  31.73 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  34.02 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  31.09 
 
 		 413 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  29.11 
 
 		 452 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.65 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  29.41 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2895  hypothetical protein  33.98 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>