More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2895 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2895  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  738    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.510368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0209  FAD linked oxidase domain-containing protein  63.73 
 
 		 358 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.220436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2501  FAD linked oxidase-like  58.89 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  62.67 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.93 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0691  FAD linked oxidase-like  55.01 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1765  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.35 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.360352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0677  FAD linked oxidase domain protein  57.38 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.9 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.64 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5254  FAD linked oxidase domain protein  55.53 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.961899 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4398  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.86 
 
 		 377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833067  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.12 
 
 		 396 aa  325  9e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5330  FAD linked oxidase domain protein  56.22 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0451  FAD linked oxidase domain protein  50.75 
 
 		 399 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  48.74 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5788  glycolate oxidase subunit  49.06 
 
 		 405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0363  FAD linked oxidase-like  47.62 
 
 		 402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3011  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.61 
 
 		 410 aa  302  6.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0181  glycolate oxidase, subunit GlcE  49.87 
 
 		 410 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.392345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  44.72 
 
 		 412 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  44.96 
 
 		 413 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  44.25 
 
 		 416 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2541  FAD linked oxidase domain protein  46.21 
 
 		 401 aa  279  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  46.15 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  43.41 
 
 		 413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  43.24 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.14 
 
 		 437 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  44.13 
 
 		 416 aa  265  8e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2549  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.3 
 
 		 392 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1869  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.09 
 
 		 403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  40.68 
 
 		 406 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3314  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.76 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.55 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2928  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.27 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.67 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2792  glycolate oxidase FAD binding subunit  40 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0844  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.7 
 
 		 356 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70680  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.06 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.36 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6131  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.33 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2038  FAD linked oxidase domain protein  39.41 
 
 		 353 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.95 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.7 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.22 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.08 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  37.85 
 
 		 352 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0187  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.59 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.06 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1638  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.6 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.44 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1361  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.73 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0480  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.81 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0123  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.53 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239299  normal  0.299437 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1664  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.45 
 
 		 370 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.29 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0649  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.36 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0242  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.13 
 
 		 404 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2515  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.23 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3438  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.74 
 
 		 350 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2667  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.41 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.779861  normal  0.298622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0304  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.68 
 
 		 422 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.19 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0623  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.1 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.69 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3256  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.84 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  38.69 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3639  FAD linked oxidase  37.96 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.162015  normal  0.957276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.22 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2497  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.87 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02847  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.19 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02797  hypothetical protein  36.19 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.152716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.4 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.91 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3979  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.74 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0701  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.24 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0249  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.24 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0733  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.24 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3819  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.97 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.98213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0719  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.16 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0722  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.91 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.87 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0992  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.51 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137928  normal  0.200899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2903  glycolate oxidase FAD binding subunit  36.24 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0718  FAD linked oxidase domain protein  35.64 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0174  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.52 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.332966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3151  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.64 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5492  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.37 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4939  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.18 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2218  glycolate oxidase FAD binding subunit  35.18 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000776663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0046  glycolate oxidase FAD binding subunit  37.88 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1171  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.57 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.829373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1651  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.68 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0468167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1290  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.74 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3343  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.12 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1886  glycolate oxidase FAD binding subunit  32.14 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.662543  normal  0.0155571 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1191  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.01 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3297  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.01 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2600  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.01 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>